在分析对接结果，以及相互作用力的时候，我们需要一张二维图像来万完美的展示作用力，当然也需要三维的，这次讨论的是二维的作用力展示。
LIGPLOT
网址:https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/software/LIGPLOT/
可以直接下载，免费，不过安装过程的话，估计我可能得再重新写一篇。
1：这个是主界面
image.png
2：导入蛋白
image.png
3：直接输入ID号或着点击browse装载自己的蛋白文件
image.png
4：接下来的界面，ligplot是分子和蛋白，dimplot是蛋白和蛋白或者蛋白和多肽之间的结合。这次是蛋白和分子，选择其中一个任意就好，点击run。
image.png
5：结果，半圆形为疏水性相互作用，Aer601为紫色，C原子黑色，氧原子红色，氮原子蓝色，氢键相互作用是绿色，Nap268为配体分子。
image.png
6：结束
相互作用图二维展示 在分析对接结果，以及相互作用力的时候，我们需要一张二维图像来万完美的展示作用力，当然也需要三维...
背景介绍 CellPhoneDB是公开提供的精选受体，配体及其相互作用的存储库。配体和受体均包含亚基结构，可准确代...
1.项目说明 采用分子对接技术研究配体分子1 与受体端粒DNA 的结合模式（图1）。 2.计算方法 从RCSB P...
细胞信号转导 1、受体与配体～图一 2、受体的分类～图二 3、膜表面受体～图三、图四、图五 离子通道偶联受体 G蛋...
摘要 小配体-受体相互作用是生物学中许多基本过程的基础，也是医学上对人类疾病进行药物干预的基础。我们在此报道了一种...
EC0489是叶酸和去乙酰长春碱酰肼的偶联物，是叶酸受体 (FR)的高亲和力配体。 难治性或转移性肿瘤。 小分子-...
用途 使用UCSF DOCK 6.9程序进行分子对接计算，研究小分子与小分子（主-客体）的结合模式与相互作用。例如...
去除水分子和配体
在多细胞生物体中，细胞间的通讯通常涉及分泌的配体-受体(LR)相互作用，这对各种生物现象都是是至关重要的。 单细胞...
在本文中，我们尝试模仿绘制文献中的Figure 2a，所选文献为J. Med. Chem. 2016, 59, 4...
本文标题：受体与配体（小分子）之间的相互作用图-二维
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/pkdulctx.html
网友评论