系统性红斑狼疮(SLE)的临床和病理多样性阻碍了诊断、管理和治疗的发展。科学家们进行了一项研究,通过综合分子表型分析和机器学习聚类来解决系统性红斑狼疮的异质性。
198位成人系统性红斑狼疮患者提供血浆、血清和RNA。根据微阵列基因表达数据,计算29个共表达模块得分。血浆可溶性介质(n = 23)和自身抗体(n = 13)采用多重比珠法和ELISAs测定。通过机器学习结合K-means聚类和随机森林分析共表达模块得分和可溶性介质来识别患者群集。
咽部分数与干扰素、浆细胞和细胞周期选择模块。共表达模块和可溶性介质分化出7个具有独特分子表型的SLE患者群集。炎症和干扰素模块在中度亚型和强烈亚型中升高,而亚型4中的T细胞模块降低。单核细胞、中性粒细胞、浆细胞、B细胞和T细胞模块区分了其余的簇。活跃的临床特征在集群中是相似的。临床症状倾向于3和4组,尽管3组缺乏强的干扰素和炎症信号。肾活动在第4组更为频繁,在第2、5和7组少见。血清学结果在2组和5组中最低。肌肉骨骼和粘膜的活动在所有集群中都很常见。
分子谱可以帮我们区分不明显的系统性红斑狼疮亚型。对这些特征的前瞻性纵向研究,可能有助于改善预后评估、临床试验设计和精准医疗方法。
参考文献:
Guthridge JM, Lu R, Tran LT, Arriens C, Aberle T, Kamp S, Munroe ME, Dominguez N, Gross T, DeJager W, Macwana SR, Bourn RL, Apel S, Thanou A, Chen H, Chakravarty EF, Merrill JT, James JA.Adults with systemic lupus exhibit distinct molecular phenotypes in a cross-sectional study.EClinicalMedicine. 2020 Mar 4;20:100291. doi: 10.1016/j.eclinm.2020.100291. eCollection 2020 Mar.
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