题目主要是来源于要对一篇文章中的图复现,其实已经在公众号上的七步走纯R代码通过数据挖掘复现一篇实验文章(第1到6步...
一文解决TCGA任意肿瘤的差异lncRNA,miRNA,mRNA
前一段时间TCGA数据库改了版,TCGAbiolinks包原来的代码没有办法获取相关的mRNA和lncRNA数据,...
寻找TCGA数据库中既含有TNBC组织又含有正常组织的病人,把数据下载下来,跑流程。总共有十个病人。代码过程如下。...
前面给大家讲解过新版的TCGA数据库中,RNAseq的表达矩阵中加入了一列gene type。 ☞[https:/...
在ceRNA相关的研究中,例如circRNA-miRNA-mRNA,或者lncRNA-miRNA-mRNA的靶向关...
mRNA的提取 lncRNA的提取
做长链非编码RNA(lncRNA)的数据分析,有一个部分是比较mRNA和lncRNA在染色上的分布密度,做完His...
mRNA-seq上中游分析需要用到Linux系统的terminal! 尽管TCGA数据库中已经提供了大量的处理好的...
通过lncRNA获得结合的miRNA(3个miRNA预测数据库中都存在),再获得miRNA作用的靶基因mRNA,靶...
本文标题:TCGA数据库中的TNBC病人,lncRNA和mRNA分开做的差
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/pkmxwctx.html
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