1. 关键基因（hub gene）
- 关键基因（hub gene）是在生物学过程中发挥至关重要作用的基因，在相关通路中，其他基因的调控往往要受到该基因的影响
- 因此， hub gene 往往是重要的作用靶点和研究热点
- 可以通过共表达或蛋白相互作用构建互作网络，然后根据网络拓扑结构筛选关键基因
2. Cytoscape 筛选关键基因
- 通过Cytoscaoe 构建蛋白/基因的互作网络后，较多的node 和edge 往往会掩盖真正的关键基因，影响筛选过程。
- 通过算法对网络结构和节点间加权重联系的计算分析，可以筛选出重要的hub gene
3. CytoHubba
- CytoHubba 是Cytoscape 插件
- 通过12种算法，较为准确地找到hub gene
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安装
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导入差异表达基因
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颜色越深越重要
4. 点击export 导出12种算法数据比较
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如果12种算法都觉得这个基因重要，说明这个基因很有研究意义，下图是12种基因重要性排序
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