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流式结果总是不好看?这些对照原则了解下

流式结果总是不好看?这些对照原则了解下

作者: 7aabdaa41cae | 来源:发表于2019-05-30 13:58 被阅读180次

    前言

    关于流式实验,有的同学说,今天简单地检测一下细胞凋亡,就不需设置空白对照和单染对照,根据未处理组设定就行;然而也有人说,你这样的对照设置是不可取的。那么有关流式实验的对照设置,你的心中是否存在一些疑惑呢?实际上,对照在任何实验中都是必不可少的,尤其在流式细胞术中,只有合理对照才可以将实验结果和背景区分,排除非特异性的效应,获得高质量的数据。所以单一阳性对照已经很难满足其实验要求,只有对照设置的越充分,得到的实验结果才会越精准。

    首先,我们需要了解非特异性信号产生的原因

    比如常见的肿瘤细胞自发荧光,会造成背景信号干扰;又如,单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞和B细胞上,Fc受体均呈现高表达,在染色过程中抗体Fc端与细胞表面Fc受体的结合以及抗体与细胞的物理结合与粘附等,在这些细胞可能通过Fc结构域而不是抗原特异性Fab结构域与抗体发生结合,造成非特异性染色的发生;除此外,样本中的死细胞不仅具有更强的自发荧光,而且更容易产生非特异性抗体的结合,造成假阳性。为了避免上述情况,在流式抗体染色前需要使用Fc受体阻断剂和鉴别死细胞的活性染料对Fc受体及死细胞造成的非特异性染色加以去除。

    除此之外,我们还需要根据实验具体情况设置五种对照来排除非特异性信号,下面将逐一讨论:

    1. 空白对照(未染色对照)

    对于细胞的自发荧光,可以设置空白对照用以区分细胞的自发荧光和特异性荧光,如图1所示:先去除黏连体,再经FSC-SSC图寻找到目的细胞群,然后圈出活细胞(图1 a),接着依据空白对照细胞自发荧光的强度确定阴性细胞群的位置,电压偏小阴性细胞群左侧会压线,电压过大,背景信号增加(图1 b)。

    图1:空白对照及电压的调节(图片来自于网络)

    2. 同型对照

    在流式细胞术中,染色的背景水平是一个重要的影响因素,特别是在为罕见的低表达或者连续表达的细胞建立多色模板时,需要设置同型对照,同种型对照的作用是消除由于抗体非特异性结合到细胞表面的Fc受体及静电结合而产生的背景染色。

    如图2 a所示荧光组成为:细胞自发荧光;如图2 b所示荧光组成为:细胞自发荧光和非特异性标记荧光(抗原和同型对照抗体的结合);如图2 c所示荧光组成为:细胞自发荧光、非特异性标记荧光和特异性标记荧光(抗原和正常抗体的结合)。

    图2:Fc受体、抗原和抗体结合的示意图

    举例:下面以活化指标CD38为例阐释同型对照的重要性,图3灰色曲线为未染色样本,黄色曲线为同型对照,红色曲线为特异性抗体染色,如果在没有同型对照的情况下,以未染色样本的阴性峰最低位置划门,阳性信号的比例为95%,当以同型对照阴性峰最低位置划门,阳性信号的比例变为80%,阳性信号波动范围达到15%,这将会对实验数据的准确性造成极大干扰。

    图3:空白对照和同型对照的比较(图片来自于网络)

    如何选择同型对照?

    一般选择相同种属来源、相同亚型和亚链、相同荧光标记但由未免疫动物血清纯化而来的抗体,比如抗鼠的CD11b BV711标记的抗体,成份是Rat IgG2b, κ。那么相应的同型对照应该是BV711标记的Rat IgG2b, κ Isotype Control。此外,需要注意的是,有些抗体的浓度和同型对照抗体的浓度不一致,使用时,应当以相同剂量为准。

    在一些特殊情况下,我们可能会选择纯化的一抗+荧光标记的二抗的组合形式,这种情况下,应该选择一抗的同型对照,比如:COX-2的纯化抗体,成分是Mouse IgG1,κ,其同型对照是纯化的Mouse IgG1,κ,荧光二抗是BV421标记的抗小鼠IgG1,染色方案如下:样本管:纯化的COX-2+BV421标记的抗Mouse IgG1(二抗)+样本;同型对照管:纯化的同型对照+BV421标记的抗Mouse IgG1(二抗)+样本。

    3. 单染和补偿对照

    由于荧光素发射光不是一个单一的波长,而是覆盖一定范围,所以会有荧光渗漏到邻近波长的检测器,多色流式实验时,测量的颜色越多,越容易发生荧光渗漏,单染对照可以显示出不同荧光团之间光谱重叠的水平,并据此去除或补偿它们之间的重叠。

    举例:与空白对照原理相似[1](图4 a),根据单染对照细胞的荧光强度确定阳性细胞群的位置,电压偏小时,阴性细胞群与阳性细胞群不能区分开,电压过大时,细胞过于离散导致背景信号增加(图4 b),图4 c和4 d分别显示出APC-H7和Ax700以及B-530和B-585之间有补偿,补偿调节的目标是使单阳性群体的阴性指标MFI(平均荧光强度)和阴性群体的阴性指标MFI一致,在流式图上最终呈现出“横平竖直”的形状(图4 c右和图4 d中),图4 d左为补偿没有调节到位,图4 d右为补偿调节过度,有时根据单染对照和样本确认补偿适当后,由于样本之间的差异或者操作不当,样本会出现图4 e中FITC通道的阳性细胞群偏向PE通道,此时,可以在上机检测时单独对这个样本进行补偿调节。如果图4 e中,FITC标记Annexin V,PE标记PI,检测细胞凋亡,出现图4 e中的情况,在未调节补偿的情况处理数据,那么很可能导致早期凋亡细胞的比例降低,而晚期凋亡细胞的比例增加。

    图4:单染对照及补偿的调节(图片来自于网络)

    4. 荧光减一对照(FMO)

    荧光减一对照(Fluorescence Minus One,FMO)是指实验设计里的所有荧光减去一个荧光后染色的细胞样本。多色流式实验中,检测指标越多,越容易发生荧光溢漏,这非常影响设门的准确性,尤其是表达水平极低、需要从较大比例的阴性群体中识别阳性信号时,为了排除干扰信号,确定设门的准确性,FMO便显得尤其重要。

    ①  FMO排除干扰信号:

    举例:多色流式实验中,有时,不可避免的会选择发射波长相近的荧光抗体,如图5 a所示,AF700单独检测IFN-γ,峰形图正常,而当荧光染料超过10种以上,此时,AF700检测IFN-γ,可能出现图5 b的峰形图,阴性峰的背景过宽,延伸到负轴以下,这样的图形明显不正常,可能与补偿有关,分析染色方案后发现BV711和AF700的发射波长比较接近,两者之间补偿比较大,可以增加一个BV711 FMO样本,此时,如图5 c显示IFN-γ的峰形图变成正常,因此,通过FMO样本的使用,我们可以排除干扰信号,得到正确的流式图。

    图5:FMO排除干扰信号(图片来自于网络)

    ②  FMO确定圈门的界限:

    举例:在一个多色流式实验中,如图6 a所示的4种荧光标记,如果仅有空白对照和单染对照,依据空白对照进行圈门,圈门的界限将是图6 b两条横线中偏下的横线,如果在空白对照和单染对照的基础上,增加一个PE通道的FMO,此时,圈门的界限将是图6 b偏上的横线,那么FITC和PE双阳性细胞群的比例将明显降低,这将影响实验结果的准确性[2]。

    图6:FMO确定圈门的界限[2]

    5. 生物学对照

    生物学对照即我们所有实验都需设计的对照组,可以理解为文献中的Control或者是Vehicle组。如细胞内染色实验涉及固定和透膜,这些步骤会影响抗原检测,自发荧光,荧光素亮度和细胞形态,生物学对照显得更为重要。

    举例:在细胞因子释放的检测实验中,未刺激和完全刺激的样品对于确定细胞因子的动态变化是很重要的,比如,PMA和Ionomycin刺激CD3+ T细胞,活化的CD3+ T细胞分泌IFN-γ,Golgi plug抑制IFN-γ的胞外转运,4 h后,收集样本,流式检测IFN-γ的表达情况,图7 a只加入Golgi plug,作为生物学对照未刺激组,IFN-γ的比例只有0.21%,而图7 b 加入PMA、Ionomycin和Golgi plug,作为完全刺激组,IFN-γ的比例有13.9%,IFN-γ的表达明显增加,图7 c 加入PMA、Ionomycin、Golgi plug和药物,作为药物处理组,IFN-γ的比例增加到25.5%,因此,图7可以确定细胞因子IFN-γ的动态变化。

    图7:细胞因子IFN-γ的流式检测

    通过以上分析,我们可以发现,对照的正确应用能够使我们的实验结果更为清晰与准确。在流式实验,尤其是多色流式中,对各种对照的充分理解与恰当应用是实验取得成功的前提,也是对实验者综合水平的一大考验。愿大家能够从本文中有所收获,得出准确、漂亮的流式实验数据。

    参考文献:

    [1]Chen G, Huang A C, Zhang W, et al. Exosomal PD-L1 contributes to immunosuppression and is associated with anti-PD-1 response[J]. Nature, 2018, 560(7718): 382-386.

    [2]Perfetto S P, Chattopadhyay P K, Roederer M. Seventeen-colour flow cytometry: unravelling the immune system[J]. Nat Rev Immunol, 2004, 4(8):648-55.

    来源:原创: Eliza 邦耀实验室

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