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如何找到称心如意的抗体--不要自己瞎找啦

如何找到称心如意的抗体--不要自己瞎找啦

作者: 冻春卷 | 来源:发表于2019-03-12 21:23 被阅读50次

    买抗体是永远的头等大事

    试剂千万种,靠谱第一条,抗体没买对,延毕两行泪。
    你一定问过这个问题,怎么挑抗体?
    答案常有以下几点:

    1. 买大品牌,CST、Abcam、Sigma、R&D、Novus、Invitrogen、Sant Cruz(等一下,乱入了)
    2. 看文献啊,高分文献用得好辣就是好用!
    3. 看文献的材料是否相近,越相似越有参考性!
    4. 文献的结果越样子有点丑丑的,越原始越有参考性(当然我见过很多人做的很完美的WB)
    5. 甄别好抗体:很多抗体在网页上可以由客户提交评价或者打分,比如Abcam。

    可以说,以上方法都是大家口口相传的选抗体经验。

    但以上这种大家耳熟能详的方法我们及不谈啦

    那么我们说点最近我遇到的新鲜的办法吧~今天我们仍然用最经典的p53作为例子。

    1. GeneCards

    这个发现依赖于谷歌搜索,也依赖于之前学生信的时候遇到的GeneCards。
    在谷歌搜索上输入TP53,给我返回的是以下界面,猜测谷歌也会记住我的搜索历史,给我推我最经常访问的网站:维基百科,NIH,NCBI还有GeneCards。
    前三个相信大家都很熟悉,GeneCards是我学生信以后才认识到的,且我认为GeneCards在某方面我更喜欢访问。

    TP53 in Google search
    GeneCards其实提供的信息更加多,简单查看基因的基本情况或者说是一览,我认为GeneCards比NCBI要更加简单易看得多(歪个楼,顺手推一波GeneCards)。
    GeneCards
    简单奉上TP53的GeneCards信息https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=TP53
    那么在GeneCards上直接就给出了部分拥有相对应于这个基因的产品的厂家,抗体啦、人工合成蛋白啦等等。下面来看看TP53的抗体情况,讲真我不明白为啥没有CST的抗体。后来我发现不仅TP53没有,其他的也没有,显然是可能没达成什么协议吧。
    TP53 antibody in GeneCards
    可以直接从GeneCards给的链接进去看,酱紫就不用一个个的打开各大公司的官网去查询啦~

    2. Validated Antibody Database

    其实我今天要讲的是这个Validated Antibody Database,顾名思义就是经过验证的抗体啦~https://www.labome.com/index.html
    这个工具厉害了,我曾经试过在Santa Cruz上p53 sc-126这支抗体的信息那里看到几千篇引用文献,可以直接点击文件查阅看看抗体效果(CST等一些其他品牌也可以做到)。但这个database直接将某个基因相应各个公司的抗体的validation情况收集起来,供大家简单参考。
    可以对基因找不同抗体,也可以对某只抗体的情况做介绍,可以说简直是棒棒哒!

    VAD

    在这里我们可以看到,对于p53基因来说,Santa Cruz这支抗体简直是妥妥的王者,而CST的2524也还不错

    VAD

    而这结果,跟我一点一点的查看抗体的citation是一致的。

    欢迎大家给我提供自己得心应手的好办法,等待~~

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