批量下载转换植物类基因的序列、编号

因为各种植物都需要进行基因编号转换，各种编号之间对应关系如何呢？最无奈的时候，我写爬虫爬NCBI，现在不用爬虫了。两个工具解决这个问题。

1. https://warwick.ac.uk/fac/sci/moac/people/students/peter_cock/python/genbank/
   此工具，暂时没有研究。
2. ensembl各种工具都有

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使用的是 ensembl.gramene的biomart
有对应的视频教程。见上面的链接。
快速使用：
选择plant gene60 > zea mays

image.png

点击filter，选择gene > maizegdb数据 >选择对应格式>上传csv文件

deg.csv

csv格式如上图所示。最多500个基因。

image.png

点击左侧栏目Attributes，>feature>选中geneid,trans,根据需要选择对应选项。

image.png

点击左上角，result.

image.png
选择文件>csv>go
生产mart_export.txt,即为对应的转换结果。