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一篇2区的基因家族分析文章带你飞

一篇2区的基因家族分析文章带你飞

作者: 组学大讲堂 | 来源:发表于2019-05-28 21:17 被阅读7次

    BZR(BRASSINAZOLE-RESISTANT)家族基因是编码参与油菜素内酯信号转导的植物特异性转录因子,在植物生长中起着至关重要的作用。

    今天小编就给大家带来一篇甜菜中BZR基因家族分析的文章。文章于2019年5月9日在线发表在BMC Plant Biology(影响因子3.93,中科院分区二区)。

    具体分析内容如下:

    一、甜菜中BvBZR基因的鉴定

    通过鉴定,共鉴定出6个BvBZR基因:Bv5_cuziBv_epwrBv1_fxreBv6_nyuwBv1_qnjnBv_yfzt

    二、Motif分析和系统发育分析

    为了阐明BZR家族的进化关系,作者基于来自甜菜、拟南芥、水稻和大白菜的41个BZR家族成员的氨基酸序列构建了系统发育树,并进行了motif分析。

    三、BvBZR基因染色体分布和基因结构分析

    作者将鉴定的6个BvBZR基因定位到了甜菜基因组的5条染色体上,并对基因结构进行了分析。

    四、BvBZR基因的顺势作用原件分析

    五、不同甜菜品种根茎的生长特征规律统计

    作者统计了包括主根的生长曲线(根重)、主根的生长速度、主根的含糖量以及主根含糖量的增加速率4个指标。

    六、与甜菜生长特征相关的基因表达模式和相关性分析

    七、BvBZR基因在E型和Z型根、茎、叶组织中表达模式分析

    八、BvBZR基因对植物激素响应的基因表达模式分析

    为了研究BvBZR基因的表达水平是否受外源植物激素的调节,作者对甜菜根喷洒了IAA、ABA、MeJA、GA3共4种植物激素,并检测了BvBZR基因的表达水平。

    九、BvBZR基因的亚细胞定位

    作者首先使用Wolf PSORT软件对BvBZR基因进行亚细胞定位预测,并采用实验手段对预测结果进行了验证。

    总结

    到此为止,这篇基因家族类文章的所有分析就完成了,在内容上还是比较常规的,只是在实验方面补充了因的亚细胞定位实验和一些生长指标,并没有复杂的实验操作和分析内容,值得大多数研究者借鉴!

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