转录组
1、广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合。
包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA以及非编码RNA。
2、狭义上指所有mRNA的集合。
蛋白质是行使细胞功能的主要承担者,蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述,转录组成为研究基因表达的主要手段,也是连接基因组遗传信息与生物功能的必然纽带,转录水平的是研究最多的,也是生物体最重要的调控方式。
转录组测序
通过第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。一般转录组测序指对mRNA反转录cDNA进行转录组测序分析。
编码RNA
mRAN,又称为信使RNA,是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。mRNA存在于原核生物和真核生物的细胞质及真核细胞的某些细胞器(如线粒体和叶绿体)中。
特点:
1、原核生物mRNA常以多顺反子(见)的形式存在真核生物mRNA一般以单顺反子的形式存在;
2、原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的,即转录尚未完毕,蛋白质的转译合成就已开始。真核生物转录的mRNA前体则需经后加工为成熟的mRNA与蛋白质结合,生成信息体后才开始工作;
3、原核生物mRNA半寿期很短,一般为几分钟,最长只有数小时(RNA噬菌体中的RNA除外)。真核生物mRNA的半寿期较长,如胚胎中的mRNA可达数日;
4、原核与真核生物mRNA的结构特点也不同。
非编码RNA MicroRNA(miRNA)
是一类内生的、长度约20-24核苷酸的小RNA,在细胞内具有多种重要的调节作用,参与许多生命过程,如细胞增殖、细胞凋亡、脂肪代谢和细胞分化等。
特点:
1、高度保守性:miRNA保守性具有重要的生物学意义,提示在不同生物发育过程中,miRNAs具有相同的调控机制;
2、时序表达特异性性:在不同组织、不同发育阶段,miRNA的表达水平有显著差异,miRNA表达是动态调控的;
3、组织表达特异性:一些miRNA表达具有细胞和组织特异性。
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长链非编码RNA(lncRNA)
是一类长度大于200核苷酸的非编码RNA,其在转录沉默、转录激活、染色体修饰、核内运输等均具有重要的功能。
特点:
1、 lncRNA的长度在200-100000nt之间,具有mRNA相似的结构,经剪接,具有ployA尾巴以及启动子结构,分化过程中有动态的表达以及不同的剪接方式,形成不同的lncRNA;
2、 lncRNA一般无蛋白编码能力,但是有很多lncRNA能编码一些短肽;
3、lncRNA的保守性较低;
4、lncRNA的表达具有组织特异性以及时空特性。不同的组织表达lncRNA的量是不同的,即使是同一组织中,处于不同状态时表达量也不同;
5、lncRNA的定位有区别。不同的lncRNA在细胞内(外)的丰度不同。
魏祎 | 文案
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