美文网首页生信分析工具包molecular biology药物数据库
网络药理学常用数据库(非肿瘤学)

网络药理学常用数据库(非肿瘤学)

作者: happyfox_9f86 | 来源:发表于2020-08-07 11:13 被阅读0次

参考:https://www.jianshu.com/p/56c7101bea2d

原作者:Peng_001

前言:本数据库的收集主要参考了Peng_001的文章,在此基础上只保留了非肿瘤专业的网络药理学数据库。以后会在学习基础上随时更新。

疾病数据库

OMIM数据库http://www.omim.org/

PharmGkb 数据库http://www.pharmgkb.org/

GAD数据库http://geneticassociationdb.nih.gov/

TTD 数据库http://db.idrblab.org/ttd/

化学结构数据库

Pubchem数据库https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

chemspider 数据库http://www.chemspider.com/

天然药物数据库

TCMSP数据库http://5th.tcmspw.com/tcmsp.php

上海有机所的中药与化学成分数据库http://www.chemcpd.csdb.cn/scdb/main/tcm_introduce.asp

TCMID数据库http://119.3.41.228:8000/tcmid/search/

BATMAN-TCM数据库http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/

蛋白分子数据库

Uniprot数据库https://www.uniprot.org/

PDB数据库 https://www.rcsb.org/#Category-search

蛋白互作数据库

STRING数据库https://string-db.org/

BioGRID数据库https://thebiogrid.org/

基因互作预测数据库

GeneMANIA数据库http://www.genemania.org

化学药物与蛋白互作数据库

STITCH databasehttp://stitch.embl.de/

Comparative Toxicogenomics Databasehttp://ctdbase.org/

功能富集分析数据库

Davidhttps://david.ncifcrf.gov/

KEGGhttps://www.kegg.jp/

WebGestalthttp://www.webgestalt.org/

高通量分析数据库

GEO 数据库https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/

TCGA数据库http://www.tcga.org/

分子对接数据库

systemsDOCKhttp://systemsdock.unit.oist.jp/iddp/home/index

CPI-BIOhttp://cpi.bio-x.cn/drar/

PharmMapperhttps://omictools.com/pharmmapper-tool

其他

软件:cytospace

编程语言:R、python

相关文章

网友评论

    本文标题:网络药理学常用数据库(非肿瘤学)

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/qlcfdktx.html