文章:Long noncoding RNAs in lipid metabolism: literature review and conservation analysis across species
背景
脂质是细胞膜的构成,充当信号分子和重要的能量来源,脂质稳态过程失调是血脂异常的原因,引发疾病:例如肥胖,糖尿病,非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)或心血管疾病。
脂质包括油三酸酯(TG),胆固醇,脂肪酸和磷脂。甘油三酯中脂肪酸的储存是主要动物的能量储备,其在能量过剩时期构成,在能量缺乏时期动员。这种储存主要发生在脂肪细胞内的脂肪组织中。
lncRNA仔物种间保守性较低,作者在人/小鼠和鸡之间发现5种直系同源的lncRNA,可能在脂质代谢中起重要作用。
结果
通过文献分析,发现60种lncRNA参与脂质代谢
作者列出60个潜在参与脂质代谢的lncRNA 。这些lncRNA中的大多数已在人(34)和小鼠(19)、大鼠(1)、猪(5)和鸡(4)中鉴定。
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab1/?report=objectonly
lncRNA的作用机制
12864_2019_6093_Fig1_HTML.jpglncRNA的不同作用机制。a在转录水平上起作用的机制,b在转录后水平上起作用 c 对蛋白质起作用。d LncRNA具有小的非编码RNA宿主的作用。E LncRNAs通过一个小翻译ORF活动。红色,lncRNA;绿色,mRNA;蓝色,miRNA;绿色,黄色和蓝色的椭圆形球体是蛋白质。
文献报告了25种lncRNA的作用机制
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab2/?report=objectonly
lncRNA在物种间的保守性
作者根据基于基因组一致性的方法在鸡与人(或鼠)之间进行直系同源lncRNA搜索。CRNDE,DHCR24-DT,NFIA -AS1,PVT1和SRA1被认为是直系同源的,lncACACA,DYNLRB2–2,MeXis,PLA2G1Bat1和TRIBAL可能是直系同源的lncRNA。它们作用于该脂质代谢关键基因的表达,如关键酶基因(FASN,SCD,ACADS,ACADVL,ATGL),脂质转运基因(ABCA1,FABP4)或脂质代谢转录因子基因(PPARA,PPARG**)。因此这些lncRNA可能在脂质代谢中起重要作用。
人/小鼠和鸡基因组之间可能保守的10个lncRNA
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6868825/table/Tab3/?report=objectonly
lncRNA在人和鸡的胚胎,肝脏,脂肪组织和下丘脑中的表达
12864_2019_6093_Fig5_HTML.jpga人和鸡之间保守的5个lncRNA 的表达。b针对此处研究的所有5种lncRNA,不同组织中所有lncRNA(淡色)的表达。胚胎(E),肝脏(L),脂肪组织(A),下丘脑(H)。
方法
文献搜索
PubMed组合术语搜索: “lncRNA” and “associated to apolipoprotein or to the 8 lipid classes”: **sterol (cholesterol胆固醇), prenol(早搏酚), fatty acid, acylglycerol (triglyceride)甘油三酸酯, phosphoglyceride(磷酸甘油酯), glycolipids(糖脂), polyketides(聚酮化合物) and sphingolipids(鞘脂).
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