BSA定位单基因性状

作者: 陈牛牛 | 来源:发表于2021-12-30 18:37 被阅读0次

在前面,我们详细介绍了经过粗定位筛选后,如何进行精细定位的详细步骤。其实在许多情况下,对基因进行定位是不需要进行精细定位的。一般由单基因控制的质量性状以及EMS诱变的基因定位都是不需要进行精细定位,直接采用BSA的方法就能定位到基因。

(Takagi et al., 2013)

        BSA(Bulk segregation analysis)又称混池分析法,这一方法一般用于由多个基因调控的数量性状的初步定位。数量性状在表型上呈现连续分布,极端表型在群体中所占的比例很小。因此选取两端的极端值进行混样建库测序能够把与目标性状相关联的SNP找出来。

        对于质量性状,在性状上的表型上是不连续分布的,只有两种表型状态。传统的图位克隆的方法虽然能够找出与数量性状相关的基因/区域。但是这种方法费时费力。而BSA则能够将依据表型选择建立两个库,最终能够定到单基因。

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