美文网首页绘图
R中文件的存储与读入

R中文件的存储与读入

作者: 生信小白花 | 来源:发表于2023-02-26 22:06 被阅读0次
20220928文件读取与存储

1. Csv文件的保存

sep读取文件时分割符的类型,决定了你输出的格式。空格分割就是txt,逗号分割就是csv。sep 是函数的形式参数,多数情况下, seq 参数用来指定字符的分隔符号。不仅用在你所提到的输出,也用在输入,也用在字符串的合并与拆分上。csv 文件是用逗号分隔的,故而 sep = ","tsv 文件是用制表符分隔的,故而 sep = "\t"常用的分隔符还有空格 sep = " "分隔符是任意的,可根据具体情况指定的。在输入的时候,原内容是用什么符号分隔的,sep就要保持一致,否则可能无法正确读取。
row.names设置是否将行号写入csv文件。row.names = 1第一列作为行名
quote设置是否在数据中加入引号
header=TRUE/FALSE(是否有表头

# 读入
geneid <- read.csv("list.csv", sep="\t", header = TRUE)
#保存
write.csv(mycounts1,file= " symbol.csv", row.names = F, quote=F)

2.txt文件

gene_exp2 <- read.table(file="gene.txt", sep = "\t", header = TRUE)
write.table(mycounts1,file= "gene_symbol.txt ", row.names = F, quote=F)

3.xls文件

方法一:xls另存为csv格式然后用read.csv

openxls通过函数read.xlsx读取xlsx文件
readxl通过函数read_xls读取xls文件
软件安装方法:install.packages("openxlsx") 以及 install.packages("readxl")

相关文章

  • R读取Excel、R与本机文件

    R读取Excel、R与本机文件 以下内容是我在R语言学习过程中的每一课的重点笔记记录。 16R语言读入本机文件 1...

  • R语言系列之3-----文件读写

    在R中,如果我们想要从外界读入文件或写出文件到特定路径该如何操作呢?读入文件,我们可以用read.table函数;...

  • R中读入txt文件报错

    因为创建的.txt最后一行没有换行,换个行到下一行的开头就没有warning了。同样的处理方式也适用于csv文件。...

  • R

    q1:r中读入csv文件时,读入所有的列合并为一列 A1:此时因为保存时是write.table(),,所以读入直...

  • R读入大文件

    在建立好了模型后,需要倒入实际运用数据来操作。把很大,甚至几个G的文件导入到R是一个问题。尝试使用read.tab...

  • 03.IO读写-1.IO介绍

    1 文件操作介绍 in: 输入,读入。从硬盘中读到内存 out: 输出。从内存写到硬盘 文件的作用: 数据存储 2...

  • 使用R语言的mice包对缺失值进行填充的一个简单小例子

    缺失值处理最简单的办法就是直接删除了,数据存储在csv文件里,使用R语言的read.csv()函数读入,然后使用n...

  • R数据格式:.rds,.rda区别

    .rds(.RDS/.Rds)和.rda(.Rdata)文件都可用于以R本机格式存储R对象。与非本机存储方法(例如...

  • R语言 CSV文件

    在R语言中,我们可以从存储在R语言环境外的文件中读取数据。 我们还可以将数据写入将被操作系统存储和访问的文件。 R...

  • 泛癌分析— (2)

    单基因数据在癌症中的表达 上面得到的result.txt文件,读入R中,进行可视化。代码如下(Rstudio): ...

网友评论

    本文标题:R中文件的存储与读入

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/rksonrtx.html