药效团模型在药物设计中最常见的应用是基于药效团的虚拟筛选、基于药效团的骨架跃迁。
基于药效团的虚拟筛选：通过从数据库中搜索满足药效团特征的小分子，可以发现具有新型结构类型的活性化合物。
如果已知靶标结构，药效团模型也可以与分子对接串联使用，即先用药效团匹配方法，获得满足药效团特征的化合物清单，然后将这些化合物再进行分子对接，可以得到既满足药效团特征，又能和靶标结合口袋具有良好结合的候选化合物。
药效团模型也可以用于全新药物设计，还可以用于药物ADMET模拟、药物潜在靶标预测（Pharm mapper），药物副作用预测等。
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本文标题：药效团模型的应用
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