正选择分析总的来说包括三步：
数据准备
将单个基因的CDS或所有比对好的CDS进行合并在一起做进化树并导出其树文件；
模型检测
使用软件如codeml或easyCodeML进行分析，并对成对模型进行LRT检验。
结果解读, 得到显著性的正选择位点.
参考：
正选择分析原理.
选择压力分析之EasyCodeML完整篇（By Raindy）. (推荐)
正选择分析之 Site Models
文章 Complete Chloroplast Genomes and Comparative Analysis of Sequences Evolution among Seven Aristolochia (Aristolochiaceae) Medicinal Species
参考: 密码子使用偏性的分析方法介绍
基金的业绩可以拆解分析，看收益率来自证券选择还是资产配置（择时）。在证券选择下面又可以继续拆解，看是因为行业选择正...
分布分析 对比分析 统计分析 帕累托分析 正太性检测 相关性分析
传递正能量；分析时代趋势；分享创业经验；助你获得健康富足的生活！选择大于努力，眼光大于能力！ 经常会有朋友问你在美...
首先明确进行竞品分析有五个步骤：明确精品分析的目的→竞品选择→选择分析维度→体验竞品产品，搜集资料、数据→操作分析...
明确竞品分析目的→竞品选择→选择分析维度→体验竞品、搜集资料、数据→操作分析并输出报告 1.明确竞品分析目的：了解...
今早打开微信，看到小伙伴们写的简书，好像是一种心灵的记录，觉得是一种自己和自己的心交流的过程，可以很好的清理思想，...
今天来分析一个女命。 （偏印） 甲子（正官） （劫）丁卯（正印） ...
总体分析 本次考卷共有三道大题,分别为基础乐园、阅读理解和笔下生花。通过批改试卷来看:在第一大题中，选择正...
主流资金之局,正奇相依; 游资的主战场在市场主流资金的阶段性市场合力股上面. 交易之道在于动态分析盈亏比; 选择阻...
背景 在生物界里面，“演化”随处不在。随着时间的推移，在自然选择压力下，生物基因组会产生一定的突变，这里包括同义突...
本文标题：正选择分析
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/roubghtx.html
网友评论