美文网首页
有部分ensembl数据库ID被取消了

有部分ensembl数据库ID被取消了

作者: 因地制宜的生信达人 | 来源:发表于2018-12-18 00:45 被阅读30次

有部分ensembl数据库ID被取消了

今天打开airway这个转录组数据,发现有些基因在gencode.v25.annotation.gtf文件里面找不到坐标信息,就搜索了一下;

ENSG00000068793

ENSG00000068793 - Ensembl

www.ensembl.org/Gene/Summary?g=ENSG00000068793

没有此网页的信息。

虽然可以看到:

Provides general gene info and summarizes expression data for all features of the gene CYFIP1 (akaENSG00000068793, CYFIP1): cytoplasmic FMR1 interacting protein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:13759]

但是进入 http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=CYFIP1

External Ids for CYFIP1 Gene

  • HGNC: 13759
  • Entrez Gene: [23191]
  • Ensembl: [ENSG00000273749]
  • OMIM: [606322]
  • UniProtKB: Q7L576

配对关系已经变化了,很不幸的是这个基因居然还是高表达量基因。

相关文章

网友评论

      本文标题:有部分ensembl数据库ID被取消了

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/rzohkqtx.html