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有部分ensembl数据库ID被取消了

有部分ensembl数据库ID被取消了

作者: 因地制宜的生信达人 | 来源:发表于2018-12-18 00:45 被阅读30次

    有部分ensembl数据库ID被取消了

    今天打开airway这个转录组数据,发现有些基因在gencode.v25.annotation.gtf文件里面找不到坐标信息,就搜索了一下;

    ENSG00000068793
    

    ENSG00000068793 - Ensembl

    www.ensembl.org/Gene/Summary?g=ENSG00000068793

    没有此网页的信息。

    虽然可以看到:

    Provides general gene info and summarizes expression data for all features of the gene CYFIP1 (akaENSG00000068793, CYFIP1): cytoplasmic FMR1 interacting protein 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:13759]

    但是进入 http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=CYFIP1

    External Ids for CYFIP1 Gene

    • HGNC: 13759
    • Entrez Gene: [23191]
    • Ensembl: [ENSG00000273749]
    • OMIM: [606322]
    • UniProtKB: Q7L576

    配对关系已经变化了,很不幸的是这个基因居然还是高表达量基因。

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