Natural variation of an EF-hand Ca 2+ -binding-protein coding gene confers saline-alkaline tolerance in maize
ZmNSA1的缺失通过增加根内Na+外流来促进茎内Na+稳态。自然发生的4 bp缺失降低了ZmNSA1-mRNA的翻译效率，从而促进了Na+稳态。怎么去验证翻译效率的问题？
在NaHCO3 中Na离子的GWAS-曼哈顿图，最高点再NSA1的3’UTR上面，对应C 有着高的Na含量
（NSA1）GRmzm2g000397编码一个假定的钙结合家族蛋白，它包含一个EF-hand结构域，但没有其他已知功能域.先前的研究已经表明，盐碱胁迫诱导胞质Ca2+的增加，这是由Ca2+结合蛋白(例如EF-hand蛋白)感知的，然后触发下游的适应性反应6，可能是grmzm2g000397编码的钙结合EF-hand蛋白感知到盐碱诱导的Ca2+信号，进而调控Na+稳态。因此，我们认为grmzm2g000397可能是zmnsa1的候选基因。
这里利用功能缺失和OE突变体，确定了再NaCO3环境中，NSA1，调节植物体内Na稳态。
a：在166个自交系中，SNP1173和InDel1032位于zmnsa1的3'UTR，属于完全LD。
c:ZmNSA1的功能变异可能是由于转录或转录后的变化。我们通过qRT-PCR检测发现，Hap1和Hap2自交系在对照和nahco3条件下的zmnsa1转录本水平相当,提示zmnsa1的功能变异不太可能与转录变化有关。相比之下，我们发现Hap1系的ZmNSA1蛋白水平显著高于Hap2系(Fig.3d)。所以，特异性抗体很重要。注意15A 的抗体和15B的问题。提示zmnsa1的功能变异可能是由于蛋白质丰度的变化。
鉴于之前的研究已经表明，具有不同3'UTR亚型的信使RNA可以以不同的效率被翻译37,38，我们于是检测SNP1173和InDel1032是否改变zmnsa1信使RNA的翻译效率。
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