1) 内容区（讲的啥）：

4、比较基因组
为了比较基因进化，选了11个同科葫芦科的植物，然后外类群选的拟南芥（模式植物），葡萄（为啥？），无油樟（基部类群）进行比较。得到的结果是，佛收瓜有134个基因家族是其他种里没有的，然后富集分析得到的这些独特基因是与代谢、细胞合成等相关的。然后佛手瓜与蛇瓜亲缘关系最近。

基因家族（Gene family），是来源于同一个祖先，由一个基因通过基因复制或者加倍而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因，它们在结构和功能上具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。
Mya：百万年前

5、共线性分析和WGD
在佛手瓜和南瓜中发现了旁系同源基因（41018个），占总基因数量的73.11%。佛手瓜与南瓜间比较表明在佛手瓜与蛇瓜之间有大量染色体重排事件发生。
WGD（全基因组加倍事件）对研究物种多样性具有重要意义。研究表明佛手瓜的WGD发生在与丝瓜和蛇瓜分化之后。而在丝瓜和蛇瓜之前未观察到WGD事件，这与我们的结果相一致。
6、佛手瓜果实形成的转录组和代谢组分析
将下调和上调的基因记性KEGG和GO分析，涉及植物激素合成和响应的基因的转录本发生了显著变化。这些比较组之间的重叠提供了关于茶叶果实发育的信息。在果实不同发育阶段的比较中，几个转录因子的mRNA也发生了显著变化。
代谢组和转录组之间的关联分析有助于理解控制代谢途径的转录调控机制。结果表明，与第6天相比，第3天植物激素信号转导、α -亚麻酸代谢、2-氧羧酸代谢、精氨酸生物合成和谷胱甘肽代谢富集，而第6天与第9天相比，类黄酮生物合成和积累增加。
7、讨论
佛手瓜的基因组是比较大的（在葫芦科中）。葫芦科是经历了4次全基因组加倍事件，佛手瓜的这次是属于第三次，有待进一步探索研究。在佛手瓜发育过程中，影响多种代谢途径的基因转录量增加，几种异黄酮和类黄酮化合物的含量也增加。