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学习小组Day5笔记--小明

学习小组Day5笔记--小明

作者: knightxm | 来源:发表于2020-04-06 21:43 被阅读0次

学习生信的第五天,坚持!加油!

使用事项

  • R的赋值符号不是等号,而是<-
  • 在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行
  • R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。
  • 显示工作路径 getwd()
  • 向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
  • 表格在R语言中改名叫数据框_
  • 不要只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。

数据类型

  • 向量(vector)
  • 矩阵(Matrix)
  • 数组(Array)
  • 数据框(Date frame)
  • List
  • 1、标量与向量的区别
  • 标量:一个元素组成的变量
  • 向量:多个元素组成的变量,一个向量是一排有序排列的元素。


    变量
    使用时,一般都会直接给变量定义,也就是“赋值”,字面意思是赋予这个变量一个数值(其实也不一定是数值,还可以是字符串/数据框等等)。 赋值
    如果把这几行代码都打过了,那么x就被赋值了4次,结果就是,第一次赋值被第二次的覆盖了,第二次的赋值又被第三次的覆盖了,以此类推,以最后一次为准哦。
    变量赋值以后,如图所示 变量赋值
    在哪看变量,如图所示 变量
  • 2、从向量中提取元素
  • (1)根据元素位置


    元素位置
  • (2)根据值


  • 3、数据框
    注意:数据一定要放在工作目录里,否则报错。
  • (1)读取本地数据


    读取本地数据

    sep,header是比较常用的参数。其中header,一个逻辑值,指示文件是否包含变量名称作为其第一行。 如果丢失,则从文件格式确定该值:当且仅当第一行包含的字段少于列数时,标头才设置为TRUE。;sep,字段分隔符。 文件每一行上的值都用此字符分隔。 如果sep =“”(read.table的默认设置),则分隔符为“空白”,即一个或多个空格,制表符,换行符或回车符。

  • (2)设置行名和列名
    设置行名和列名
    如果数据框不需要改,却改掉了,可以用刚才的read.table命令重新赋值一遍就可以覆盖掉刚才改错的了。代码是严格区分大小写的。
  • (3)数据框的导出


    数据框的导出
  • (4)变量的保存与重新加载
  • 变量的保存与重新加载
  • (5)提取元素


    提取元素
  • (6)直接使用数据框中的变量
    提取某两列作散点图:(提示一下,这里的case和values是两个单纯的列名,没别的意思)
    提取某两列作散点图
    这种方法有个缺点:数据框名a在代码中重复出现。

思维导图:

思维导图.png

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