莎莎写于2020.5.14✍作为单元课第一个要学的数据库：Oncomine 我竟然不知道它，而且拖到现在都没有去学，果然出来混都是要还的嘤嘤嘤😄实验部分刚开始进行，生信这边也不能丢到一边不管，毕竟是和老师说过我的宏图壮志的，怎么能就这么说过了就不管了呢。所以还是要抓住时间赶紧先学起来💪
Oncomine网址：https://www.oncomine.or
1.注册与登录
第一次打开，是这样的
主页面介绍
注册
我打开了注册界面
注册成功
image.png
但是我用我的学校邮箱没有注册成功，不知道什么原因~
后续：昨晚一直在和Oncomine的Support发邮件问我为什么没有收到邮件，弄了好久，发邮件发了5个来回，今天终于收到邮件了，太开心了！
终于收到邮件了！
那么下面就可以进行正式的操作啦~
登陆进去
自动跳转了提示你改密码的界面
改密码成功
然后就是Oncomine会给你发一个密码修改成功的邮件，然后就可以正常使用了，下次登陆的时候就可以用新修改的密码登录就好啦~🤭
确认修改密码的邮件
开心~
已登录
可以正常使用啦~
3.核心功能：基因表达差异分析
应用1
检索基因表达谱差异（乳腺癌为例）
image.png
image.png
可以多勾选几个研究结果进行比较
image.png
应用2
可以直接点击左边的Breast Cancer
image.png
image.png
image.png
2.核心功能：基因表达与临床相关性
以CPSF7为例：
image.png
image.png
在Excel中，表头输入：表达值 组织类型 样本编号 生存状态
image.png
image.png
然后在表一 用VLOOKUP函数查找
有了基因表达，生存状态以及随访时间，就可以进行生存分析了，常用的生存分析有生存曲线和COX回归；还可以把年龄，复发状态，病理分期等数据摘录下来，做单因素和多因素的分析。Oncomine也可以在线分析：
image.png
还有很多功能可以在GROUP BY中选择
4.基因共表达分析
image.png
image.png
网友评论