ClickHouse源码笔记1:聚合函数的实现

作者: LeeHappen | 来源:发表于2020-06-02 09:54 被阅读0次

    由于工作的需求,后续笔者工作需要和开源的OLAP数据库ClickHouse打交道。ClickHouse是Yandex在2016年6月15日开源了一个分析型数据库,以强悍的单机处理能力被称道
    笔者在实际测试ClickHouse和阅读ClickHouse的源码过程之中,对"战斗民族"开发的数据库十分欣赏。ClickHouse不仅是一个很好的数据库学习材料,而且同时应用了大量的CPP17的新特性进行开发,也是一个大型的Modern CPP的教导资料。
    笔者接下来会陆续将阅读ClickHouse的部分心得体会与通过源码阅读笔记的方式和大家分享,坦白说,这种源码阅读笔记很难写啊。(多一分繁琐,少一分就模糊了~~)
    第一篇文章,我们就从聚合函数的实现开始聊起~~ 上车!

    1.基础知识的梳理

    什么是聚合函数?

    聚合函数: 顾名思义就是对一组数据执行聚合计算并返回结果的函数。
    这类函数在数据库之中很常见,如:count, max, min, sum等等。

    ClickHouse的实现接口
    • IAggregateFunction接口
      在ClickHouse之中,定义了一个统一的聚合函数接口:IAggregateFunction.(在ClickHouse之中,所有的接口类都是以大写的I开头的。) 上文笔者提到的聚合函数,则都是作为抽象类IAggregateFunction的子类实现的。其中该接口最为核心的方法是下面这5个方法:
      • add函数:最为核心的调用接口,将对应AggregateDataPtr指针之中数据取出,与列columns中的第row_num的数据进行对应的聚合计算。(这里可以看到ClickHouse是一个纯粹的列式存储数据库,所有的操作都是基于列的数据结构。)
      • merge函数:将两个聚合结果进行合并的函数,通常用在并发执行聚合函数的过程之中,需要将对应的聚合结果进行合并。
      • serialize函数与deserialize函数:序列化与反序列化的函数,通常用于spill to disk或分布式场景需要保存或传输中间结果的。
      • addBatch函数:这是函数也是非常重要的,虽然它仅仅实现了一个for循环调用add函数。它通过这样的方式来减少虚函数的调用次数,并且增加了编译器内联的概率。(虚函数的调用需要一次访存指令,一次查表,最终才能定位到需要调用的函数上,这在传统的火山模型的实现上会带来极大的CPU开销。
      /** Adds a value into aggregation data on which place points to.
         *  columns points to columns containing arguments of aggregation function.
         *  row_num is number of row which should be added.
         *  Additional parameter arena should be used instead of standard memory allocator if the addition requires memory allocation.
         */
        virtual void add(AggregateDataPtr place, const IColumn ** columns, size_t row_num, Arena * arena) const = 0;
    
        /// Merges state (on which place points to) with other state of current aggregation function.
        virtual void merge(AggregateDataPtr place, ConstAggregateDataPtr rhs, Arena * arena) const = 0;
    
        /// Serializes state (to transmit it over the network, for example).
        virtual void serialize(ConstAggregateDataPtr place, WriteBuffer & buf) const = 0;
    
        /// Deserializes state. This function is called only for empty (just created) states.
        virtual void deserialize(AggregateDataPtr place, ReadBuffer & buf, Arena * arena) const = 0;
        // /** Contains a loop with calls to "add" function. You can collect arguments into array "places"
          *  and do a single call to "addBatch" for devirtualization and inlining.
          */
        virtual void addBatch(size_t batch_size, AggregateDataPtr * places, size_t place_offset, const IColumn ** columns, Arena * arena) const = 0;
    
    
    • 抽象类IColumn
      上面的接口IAggregateFunction的函数使用到了ClickHouse的核心接口IColumn类,这里也进行简要的介绍。 IColumn 接口表达了所有数据在ClickHouse之中的用内存表达的数据结构,其他带有具体数据类型的如ColumnUInt8、ColumnArray 等, 都实现了对应的列接口,并且在子类之中具象实现了不同的内存布局。
      IColumn的子类实现细节很琐碎,笔者这里就暂时不展开讲了,笔者这里就简单讲讲涉及到聚合函数调用部分的IColumn接口的对应方法:
      这里columns是一个二维数组,通过columns[0]可以取到第一列。(这里只有涉及到一列,为什么columns是二维数组呢?因为处理array等列的时候,也是通过对应的接口,而array就需要应用二维数组了. )
      注意这里有一个强制的类型转换,column已经转换为ColVecType类型了,这是模板派生出IColumn的子类。
      然后通过IColumn子类实现的getData方法获取对应row_num行的数据进行add函数调用就完成了一次聚合函数的计算了。
        void add(AggregateDataPtr place, const IColumn ** columns, size_t row_num, Arena *) const override
        {
            const auto & column = static_cast<const ColVecType &>(*columns[0]);
            this->data(place).add(column.getData()[row_num]);
        }
    
    • IAggregateFunctionHelper接口
      这个接口是上面提到 IAggregateFunction的辅助子类接口,它很巧妙的通过模板的类型派生,将虚函数的调用转换为函数指针的调用,这个在实际聚合函数的实现过程之中能够大大提高计算的效率。
      函数addFree就实现了我上述所说的过程,但是它是一个private的函数,所以通常我们都是通过getAddressOfAddFunction获取对应的函数地址。这在聚合查询的过程之中能够提高20%左右的执行效率。
    template <typename Derived>
    class IAggregateFunctionHelper : public IAggregateFunction
    {
    private:
        static void addFree(const IAggregateFunction * that, AggregateDataPtr place, const IColumn ** columns, size_t row_num, Arena * arena)
        {
            static_cast<const Derived &>(*that).add(place, columns, row_num, arena);
        }
    
    public:
        IAggregateFunctionHelper(const DataTypes & argument_types_, const Array & parameters_)
            : IAggregateFunction(argument_types_, parameters_) {}
    
        AddFunc getAddressOfAddFunction() const override { return &addFree; }
    
    • AggregateFunctionFactory类
      顾名思义,这个是一个生成聚合函数的工厂类。它的逻辑很简单,所有ClickHouse之中所相关的聚合函数都是通过这个工厂类注册并且获取,然后进行调用的。
    class AggregateFunctionFactory final : private boost::noncopyable, public IFactoryWithAliases<AggregateFunctionCreator>
    {
    public:
    
        static AggregateFunctionFactory & instance();
    
        /// Register a function by its name.
        /// No locking, you must register all functions before usage of get.
        void registerFunction(
            const String & name,
            Creator creator,
            CaseSensitiveness case_sensitiveness = CaseSensitive);
    
        /// Throws an exception if not found.
        AggregateFunctionPtr get(
            const String & name,
            const DataTypes & argument_types,
            const Array & parameters = {},
            int recursion_level = 0) const;
    

    2.聚合函数的注册流程

    有了上述的背景知识,我们接下来举个栗子。来看看一个聚合函数的实现细节,以及它是如何被使用的。

    AggregateFunctionSum

    笔者这里选取了一个很简单的聚合算子Sum,我们来看看它实现的代码细节。
    这里我们可以看到AggregateFunctionSum是个final类,无法被继承了。而它继承了上面提到的IAggregateFunctionHelp类的子类IAggregateFunctionDataHelper类。

    这里我们就重点看,这个类override了getName方法,返回了对应的名字sum。并且实现了我们上文提到的四个核心的方法。

    • add
    • merge
    • seriable
    • deserialize
    template <typename T, typename TResult, typename Data>
    class AggregateFunctionSum final : public IAggregateFunctionDataHelper<Data, AggregateFunctionSum<T, TResult, Data>>
    {
    public:
        using ResultDataType = std::conditional_t<IsDecimalNumber<T>, DataTypeDecimal<TResult>, DataTypeNumber<TResult>>;
        using ColVecType = std::conditional_t<IsDecimalNumber<T>, ColumnDecimal<T>, ColumnVector<T>>;
        using ColVecResult = std::conditional_t<IsDecimalNumber<T>, ColumnDecimal<TResult>, ColumnVector<TResult>>;
    
        String getName() const override { return "sum"; }
    
        AggregateFunctionSum(const DataTypes & argument_types_)
            : IAggregateFunctionDataHelper<Data, AggregateFunctionSum<T, TResult, Data>>(argument_types_, {})
            , scale(0)
        {}
    
        AggregateFunctionSum(const IDataType & data_type, const DataTypes & argument_types_)
            : IAggregateFunctionDataHelper<Data, AggregateFunctionSum<T, TResult, Data>>(argument_types_, {})
            , scale(getDecimalScale(data_type))
        {}
    
        DataTypePtr getReturnType() const override
        {
            if constexpr (IsDecimalNumber<T>)
                return std::make_shared<ResultDataType>(ResultDataType::maxPrecision(), scale);
            else
                return std::make_shared<ResultDataType>();
        }
    
        void add(AggregateDataPtr place, const IColumn ** columns, size_t row_num, Arena *) const override
        {
            const auto & column = static_cast<const ColVecType &>(*columns[0]);
            this->data(place).add(column.getData()[row_num]);
        }
    
        void merge(AggregateDataPtr place, ConstAggregateDataPtr rhs, Arena *) const override
        {
            this->data(place).merge(this->data(rhs));
        }
    
        void serialize(ConstAggregateDataPtr place, WriteBuffer & buf) const override
        {
            this->data(place).write(buf);
        }
    
        void deserialize(AggregateDataPtr place, ReadBuffer & buf, Arena *) const override
        {
            this->data(place).read(buf);
        }
    
        void insertResultInto(ConstAggregateDataPtr place, IColumn & to) const override
        {
            auto & column = static_cast<ColVecResult &>(to);
            column.getData().push_back(this->data(place).get());
        }
    
    private:
        UInt32 scale;
    };
    

    接下来,ClickHouse实现了两种聚合计算:AggregateFunctionSumDataAggregateFunctionSumKahanData。后者是用Kahan算法避免float类型精度损失的,我们可以暂时不细看。直接看SumData的实现。这是个模板类,之前我们讲到AggregateFunction的函数就是通过AggregateDataPtr指针来获取AggregateFunctionSumData的地址,来调用add实现聚合算子的。我们可以看到AggregateFunctionSumData实现了前文提到的add, merge, write,read四大方法,正好和接口一一对应上了。

    template <typename T>
    struct AggregateFunctionSumData
    {
        T sum{};
    
        void add(T value)
        {
            sum += value;
        }
    
        void merge(const AggregateFunctionSumData & rhs)
        {
            sum += rhs.sum;
        }
    
        void write(WriteBuffer & buf) const
        {
            writeBinary(sum, buf);
        }
    
        void read(ReadBuffer & buf)
        {
            readBinary(sum, buf);
        }
    
        T get() const
        {
            return sum;
        }
    };
    

    ClickHouse在Server启动时。main函数之中会调用registerAggregateFunction的初始化函数注册所有的聚合函数。
    然后调用到下面的函数:

    void registerAggregateFunctionSum(AggregateFunctionFactory & factory)
    {
        factory.registerFunction("sum", createAggregateFunctionSum<AggregateFunctionSumSimple>, AggregateFunctionFactory::CaseInsensitive);
        factory.registerFunction("sumWithOverflow", createAggregateFunctionSum<AggregateFunctionSumWithOverflow>);
        factory.registerFunction("sumKahan", createAggregateFunctionSum<AggregateFunctionSumKahan>);
    }
    

    这里又调用了factory.registerFunction("sum", createAggregateFunctionSum<AggregateFunctionSumSimple>, AggregateFunctionFactory::CaseInsensitive);来进行上述我们看到的聚合函数的注册。这里有一点很恶心的模板代码,笔者这里简化了一下,把注册的部分函数拉出来:

    createAggregateFunctionSum(const std::string & name, const DataTypes & argument_types, const Array & parameters)
    {
        AggregateFunctionPtr res;
        DataTypePtr data_type = argument_types[0];
        if (isDecimal(data_type))
            res.reset(createWithDecimalType<Function>(*data_type, *data_type, argument_types));
        else
            res.reset(createWithNumericType<Function>(*data_type, argument_types));
        return res;
    

    这里的Function模板就是上面的AggregateFunctionSumSimple, 而它又是下面的模板类型:

    template <typename T> using AggregateFunctionSumSimple = typename SumSimple<T>::Function;
    
    template <typename T>
    struct SumSimple
    {
        /// @note It uses slow Decimal128 (cause we need such a variant). sumWithOverflow is faster for Decimal32/64
        using ResultType = std::conditional_t<IsDecimalNumber<T>, Decimal128, NearestFieldType<T>>;
        using AggregateDataType = AggregateFunctionSumData<ResultType>;
        using Function = AggregateFunctionSum<T, ResultType, AggregateDataType>;
    };
    

    不知道读者被绕晕了没,最终绕回来还是new出来这个AggregateFunctionSum<T, ResultType, AggregateDataType>
    也就是完成了这个求和算子的注册,后续我们get出来就可以愉快的调用啦。(这里这部分的模板变化比较复杂,如果看不明白可以回到源码梳理一下~~~)

    3. 小结

    好了,关于聚合函数的基础信息,和它是如何实现并且通过工厂方法注册获取的流程算是搞明白了。
    关于其他的聚合算子,也是大同小异的方式。笔者就不再赘述了,感兴趣的可以回到源码之中继续一探究竟。讲完了聚合函数的实现,下一篇笔者就要继续给探究聚合函数究竟在ClickHouse之中是如何和列存结合使用,并实现向量化的~~。
    笔者是一个ClickHouse的初学者,对ClickHouse有兴趣的同学,也欢迎和笔者多多指教,交流。

    4. 参考资料

    官方文档
    ClickHouse源代码

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