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【RNA-Seq 实战】二、软件安装

【RNA-Seq 实战】二、软件安装

作者: 佳奥 | 来源:发表于2022-07-26 10:42 被阅读0次

使用conda安装

bash Miniconda2-.......sh

同意conda添加到.bashrc后就可以直接在环境中使用conda命令了
$ source ~/.bashrc
$ conda

进入到rnaseq环境
$ conda activate rnaseq

$ conda install -c bioconda trimmomatic

不想显示提醒:conda install trimmomatic -y 

查看环境内安装软件

(rnaseq) root 17:34:53 ~/miniconda3/envs/rnaseq/bin
$ ls

已安装的软件:

trimmomaticcutadapttrim_galore

starhisat2bowtie2bwasubread

htseqbedtoolsdeeptools

下一篇我们将进入处理流程。

我们下一篇再见!

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