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linux学习100篇21:Rstudio Server的安装和

linux学习100篇21:Rstudio Server的安装和

作者: PhageNanoenzyme | 来源:发表于2021-05-26 17:55 被阅读0次

    在本地使用Rstudio有很多的限制,不能够长时间跑程序,而服务器上能够满足R的很多条件,通过在服务器端安装Rstudio能够和本地一样使用Rstudio。服务器的Rstudio Server通过浏览器输入IP地址完成。

    注意:我这里使用的是centos 7,需要服务器的root权限。

    1. Rstudio Server的安装

    1.1 Rstudio Server

    wget https://download2.rstudio.org/rstudio-server-rhel-1.1.456-x86_64.rpm
    sudo yum install rstudio-server-rhel-1.1.456-x86_64.rpm
    

    1.2 创建配置文件

    sudo vi /etc/rstudio/rserver.conf
    sudo vi /etc/rstudio/rsession.conf   
    
    ###在两个配置文件中添加以下语句
    rsession-which-r=/usr/bin/R  ##系统的R程序所在位置,如果个人目录下有利用anaconda安装R,可能会报错。
    www-port=8787 ### 通过ip的8787端口连接
    
    

    1.3 在防火墙配置文件中添加8787端口

    sudo vi /etc/sysconfig/iptables
    
    ###在文件中添加以下语句:
    iptables -A INPUT -p tcp -m state --state NEW -m tcp --dport 8787 -j ACCEPT
    
    ### 重启防火墙
    sudo service iptables restart
    sudo netstat -anp ###查看开放的端口信息
    
    

    1.4 检查Rstudio-server是否能够运行并启动服务

    #检查配置是否完整
    sudo rstudio-server verify-installation
    
    #启动服务
    sudo rstudio-server start
    #查看状态,当出现active是,配置完成
    sudo rstudio-server status
    #[root@ lib64]#  rstudio-server status
    #● rstudio-server.service - RStudio Server
    #  Loaded: loaded (/etc/systemd/system/rstudio-server.service; enabled; vendor preset: disabled)
    # Active: active (running) since Tue 2020-07-21 10:22:57 CST; 4s ago
    
    

    1.5 打开本地的浏览器,输入IP:端口号,会出现输入用户名和密码的提示。这里的用户名和密码就是每个用户自己的用户名和密码。

    image

    2. 常见的问题及解决的方法

    需要根据上面的步骤,打开rstudio的服务以及对应的网络端口。

    2.1 RStudio Server安装完成后,浏览器无法打开ip:8787登录页,显示无法访问。

    这是因为没有正确的配置网络端口,根据1.3修改相关的配置

    image

    2.2 Rstudio server "Unable to connect to service"。在输入用户名和密码后,rstudio没有能够加载出来,并包以上出错。

    通过 rstudio-server verify-installation检查Rstudio相关的服务,并排除故障。

    3 参考网址
    3.1 https://www.jianshu.com/p/44169741bd22
    3.2 https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/435/
    3.3 https://community.rstudio.com/t/rstudio-server-unable-to-connect-to-service/40600

    作者:果蝇的小翅膀
    链接:https://www.jianshu.com/p/d3509ff51e90
    来源:简书
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