GIFT_ICA

作者: 养猪场小老板 | 来源:发表于2023-02-24 20:54 被阅读0次

    1、软件安装和;路径加载(略)

    样本存放形式

    image.png
    image.png
    需要做到平滑
    B站有视频

    2、matlab输入命令

    gift
    
    主界面

    3、ICA操作

    新建存储结果的文件夹:gica;并选择将结果放入其中。


    image.png
    image.png
    image.png
    image.png

    选中相应的文件夹


    image.png
    image.png
    image.png
    全部选完之后点击ok
    image.png
    image.png
    自动跳出,选择yes
    分析的结果显示为37
    这里选择yes,因为这个时候该功能不会起作用
    image.png
    该方法耗时较多,自己做的时候建议用这种方法
    image.png
    image.png
    Run
    image.png
    image.png
    运行中
    图a:运行后跳出的界面
    image.png

    所以图a可以用以下方式打开:


    image.png
    image.png
    RSN模板需要提前做好
    image.png

    这里选了8个模板,做的回归是模板作为因变量,各个成分作为自变量,然后做回归。beta值越高,说明与模板的相似性越高。然后生成一个mat和一个txt文件。


    各成分和模板的相关性

    该系数是和刚输入的听觉模板之间的相关系数,如果第二个突降,说明第一张是正确的。如果第一张和第二张图片中的系数相差不多,且都大于0.1,可能是同一个网络的子成分。
    一般0.2以上算可以的。
    比如默认模式网络,前默认网络0.3,或后默认模式网络0.25.
    该系数是和刚输入的听觉模板之间的相关系数,如果第二个突降,说明第一张是正确的。如果第一张和第二张图片中的系数相差不多,且都大于0.1,可能是同一个网络的子成分。
    一般0.2以上算可以的。
    比如默认模式网络,前默认网络0.3,或后默认模式网络0.25.

    各个成分和模板的相关性在这两个文件里面

    这个时候需要找到哪个模板和哪个成分的相关性最大


    8×37的数据,行为空间模板,列为成分

    这里有一个matlab代码

    %将该代码命名为find_component
    
    clear all;clc;
    load('g_spatial_regression.mat');
    ica_con= regressInfo.regressionParameters;
    name ={'Reslice_auditory','Reslice_default_mode','Reslice_dorsal_attention','Reslice_left_frontoparietal','Reslice_right_frontoparietal','Reslice_somatomotor','Reslice_ventral_attention','Reslice_visual'};
    for i =1:size(ica_con)
         row=ica_con(i,:);
         names=name(1,i);
         value{i,1}=names;
         value{i,2}=find(row==max(row));
    end
    

    结果如下


    该图的第一行的意思就是:37个成分当中第6个成分与第一个空间模板Reslice_auditory相关性最佳

    除了回归的方式,还有进行视觉检查

    image.png
    image.png
    是否需要对时间进行回归
    ok后等待

    结果

    每个成分都有一个summary

    通过两种方法:回归+视觉检查,找出相似的网络出来

    接下来,做MANCOVAN

    输入gift
    选择结果文件夹
    不过,首先加协变量
    这里是测试,一种4个样本(2对照,2实验组),这里以年龄为例,添加协变量,注意有的协变量不是连续性的。可以提前统计好,复制粘贴在这里 选择两样本统计的方式
    组1
    组2
    点击create,会生成mancovan.mat文件

    下一步,setup features

    image.png
    部分网络的成分
    纳入网络
    png
    image.png
    aa
    bb image.png
    结束

    视频里还讲了dFNC

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