Cytoscape 3.10版软件安装插件的三个办法: 使用老版本。Cytoscape 3.9版本或更低,软件自带...[作者空间]
在得到我们感兴趣的基因集后,除了对其进行GO等富集分析查看与什么重要的生物学通路相关,还可以进行PPI蛋白互作网络...[作者空间]
我们通过转录组分析能够得到许多的差异基因,这些差异基因里包含大量的转录因子。所以,我们就想去查看转录因子与差异基因...[作者空间]
在STRING数据库中提交基因,获取PPI网络是比较常规的操作,包括下游使用cytoscape进行美化和hub网络...[作者空间]
今天继续分享生信分析中常见的图形 -- Network。网络图可以直观地展示复杂系统中各元素之间的联系,从而有...[作者空间]
长链非编码RNA(Long noncoding RNA)是一类长度大于200 nt,不编码蛋白质的RNA。LncR...[作者空间]
https://mp.weixin.qq.com/s/-azPSGumKU5far5DPWDhnw[https:/...[作者空间]
Cytoscape是我们日常数据分析中最常用的网络图绘制神器。今天小编给大家推荐一款2D转3D插件 -- cy3d...[作者空间]
1.什么是蛋白互作? 在转录调控相关的文献中,我们经常能够看到这样的蛋白质相互作用网络(proteinprotei...[作者空间]
String数据库(https://string-db.org/[https://string-db.org/])...[作者空间]
Cytoscape App Store https://apps.cytoscape.org/[https://a...[作者空间]
Cytoscape安装,java问题 因为此前安装了igv,需要java 8并且安装了。现在要安装Cytoscap...[作者空间]
使用Cytoscape构建三层网络,并进行模块挖掘 我这部分要做的是”药物-不良反应-靶点”三层网络 虽然在做网络...[作者空间]
想要通过数据得到美观的图表,除了基础版的excel,专业版的Power BI和Tableau、技术版的python...[作者空间]
Summary String数据库:https://www.string-db.org 是研究网络药理学中蛋白质相...[作者空间]
其实我想画这张图,是scenic分析后转录因子的调控图。 出自健明大佬分享的教程 我记得小洁老师讲过ceRNA调控...[作者空间]
说起互作网络图,大家都不陌生。看文献的时候,经常看见相互作用网络图展示了circRNA-miRNA的靶向关系或者c...[作者空间]
这期推文的封面是一张富集分析的网络图,来自文献:Single cell RNA sequencing of hum...[作者空间]
官方手册——中 Cytoscape3.7.2用户手册[http://manual.cytoscape.org/en...[作者空间]