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Count分析基因Gain/Loss/Duplication

Count分析基因Gain/Loss/Duplication

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-05-13 09:12 被阅读0次

    文献
    标题:Count: evolutionary analysis of phylogenetic profiles with parsimony and likelihood
    中文:具有简约性和似然性的系统发育谱的进化分析
    杂志:Bioinformatics
    时间:2010
    引用:280

    地址http://www.iro.umontreal.ca/~csuros/gene_content/count.html
    java程序可直接使用

    引用文章

    文章:Insights on the Evolutionary Genomics of the Blautia Genus: Potential New Species and Genetic Content Among Lineages. Frontiers in Microbiology 2021

    方法:
    Orthofinder的基因家族结果用于count计算基因gain loss,使用 Csûrös - Miklós模型和泊松分布

    结果:

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