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YIGE1的遗传变异有助于玉米穗长和籽粒产量
摘要：全基因组关联研究 (GWAS)，我们确定了一个 QTL，YIGE1，它编码一种未知的蛋白质，通过影响雌蕊小花数来调节 (穗长)EL。 YIGE1的过表达增加了雌花序分生组织 (IM) 的大小，增加了 EL 和每行籽粒数 (KNPR)，从而提高了籽粒产量。相比之下，YIGE1 的 CRISPR/Cas9敲除和 Mutator 插入突变系显示出降低的 IM 大小和 EL。位于 YIGE1 调控区的单核苷酸多态性 (SNP) 对其启动子强度有很大影响，通过增加基因表达对 EL产生积极影响。进一步分析表明，YIGE1可能参与糖和生长素信号通路调控玉米穗发育，从而影响玉米花序形态发生中的IM活性和小花产生。
背景：
2:GWAS的广泛采用导致鉴定与性状相关的变异或复杂性状的推定候选基因迅速爆炸，特别是在玉米中，其特点是 LD 快速衰减
3:生长素通过影响腋生分生组织的起始和形成来调节花序发育
4：在这项研究中，我们使用 GWAS 绘制了 qEL1，这是 1 号染色体上 EL 的主要 QTL，并克隆了潜在的功能基因（B73 Ref_V2 中的GRMZM2G008490），我们将其命名为 YIGE1。YIGE1通过提高生长素浓度、IM 活性和小花产量对 EL 产生积极影响。含有 qEL1 有利等位基因的自交系表现出更高的启动子活性、更高的 YIGE1 表达和升高的EL。
结果
1：YIGE1正向调节玉米穗长
cas9和OE的表型，
2：YIGE1 启动子区域中的单个 SNP 有助于表达和穗长变化
重测序结果，找到SNP与表达量相关‘’
e：luc验证，snp
3：YIGE1的表达与花序分生组织大小和穗长呈正相关
4：RNA-seq预测YIGE1 参与糖和生长素信号通路
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