使用conda安装RepeatMasker

之前使用conda安装RepeatMasker，需要注意以下问题，现在整理一下：

首先使用conda安装软件，

conda install RepeatMasker

我的conda是装在annotation里的，所以安装好的RepeatMasker是在share里面的

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切换至所在目录 ，配置文件

./configure

提示会有依赖环境缺少，主要是指定trf、rmblastn，使用conda既可安装。

所依赖的注释库可以在官网下载，因为注册较麻烦，可以用我下载的版本

链接：https://pan.baidu.com/s/14gM8kurJRaA1ZZC3fG84jQ

提取码：2jg3

使用wget下载到RepeatMasker目录下，再用tar -zxvf解压文件，继续配置文件

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载入数据库：

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配置完成后运行脚本：

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生成文件：

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统计信息：

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之前在云服务器上试了用conda装RepeatMasker，装不了，可能是配置不是很好的原因，所以用安装包的方式进行了安装，效果是一样的，这里就不再赘述。