关于 Gene model
弄清楚这些概念：
- 在基因组的水平上 promoter and gene body
- 在转录组的水平上 exon and intron
- 在翻译的水平上 cds
** 科学网上有很好的总结：http://blog.sciencenet.cn/blog-1271266-792469.html
关于注释文件的注意点：注释文件中一条记录的分布情况是
image.png
弄清楚这些概念：
** 科学网上有很好的总结：http://blog.sciencenet.cn/blog-1271266-792469.html
关于注释文件的注意点：注释文件中一条记录的分布情况是
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输入文件有：物种基因组序列文件、物种基因组注释文件、转录本比对后的BAM文件；以斑胸草雀为例：-基因组注释文件: ...
参考 UCSC数据文件格式基因组数据注释常用的文件-Bed文件和GFF文件 1、简介 注释文件就是基因组的说明书。...
IGV软件有自带的基因组文件和注释文件，使用自带的还是方便一些。但是，其使用的注释文件和基因组文件可能与我们数据分...
关于 Gene model 弄清楚这些概念： 在基因组的水平上 promoter and gene body 在转...
一、文件准备 基因组文件：r498.fa 与基因组对应的注释文件：r498.gff (最好是gtf 格式，后续需要...
基因类型的鉴定 基因组组装和注释完成，得到配套的基因组和注释文件之后，可以利用gffread提取对应的gene，c...
处理原始数据和参考基因组数据后，开始比对分析。将比对所需参考基因组的索引文件和基因组注释文件存放于hg19文件夹，...
最近接到一个任务，使用STAR构建基因组索引，需要准备的数据是基因组文件和注释文件。 STAR（Spliced T...
下载参考基因组所需的三个文件：1.基因组序列(genome.fa); 2.基因注释文件(genes.gtf)；3....
我们已经知道 BED 与 GTF 文件用于存储基因组区域与基因组特征注释信息。还有一种文件用于存储高通量read比...
本文标题：关于基因组注释文件
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/vvhrkxtx.html
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