day7 测序技术知识——罗wb
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测序技术原理及常用数据格式简介(*****)
https://mp.weixin.qq.com/s/zPa2G5gzl-sTFAi-qAzbvA
各测序技术的参数及特点
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各测序技术、公司、仪器的研发史
https://mp.weixin.qq.com/s/GReWY8yq7O_xVnajknrHZQ
简化基因组测序
http://www.lc-bio.com/news/show-484.html
http://www.gencracker.com/?page_id=269
WES
https://ml.mbd.baidu.com/r/Fel3KazOxO?f=cp&u=c4580ae8d8fa4795
不同测序组学的用途
https://mp.weixin.qq.com/s/SAnCLBTxfi4BaCnuaAVCpQ
测序常用术语
https://mp.weixin.qq.com/s/oGylvM0HC8GUImxYN1AEVw
测序数据文件格式
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格式解析
https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format1
格式转换
Fastq文件→Fasta文件(Linux命令):
法1:sed '/^@/!d;s//>/;N' your.fastq > your.fasta
法2:seqtk seq -A input.fastq > output.fasta
EMBL → Fasta格式转换(在线工具):
http://www.geneinfinity.org/sms/sms_embltofasta.html
文件处理
FASTX-Toolkit(用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序,里面包含了丰富的Fasta/Fastq文件格式转换、统计等命令。)
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