linux环境下的软件安装
1、如何下载miniconda
- 百度/谷歌搜索“miniconda 清华”,进入“清华大学开源软件镜像站”
- 输入命令“ uname -a”安装最新版本
- 输入命令“cd ~/biosoft”进入biosoft目录，将软件下载到这里
- 输入命令“wget 链接”进行下载
- 输入命令“bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh”进行安装
- 输入命令“source ~/.bashrc”来激活conda
- 输入命令“conda”出现满屏信息说明安装完成
2、使用conda
- 命令“conda list”：查看当前服务器上安装的所有软件列表
- 命令“conda search fastqc”：搜索conda软件
- 命令“conda install fastqc -y”：安装软件
- 命令“conda remove fastqc -y”：卸载软件
- 命令“conda info --envs”：查看当前conda有那些环境
- 命令“conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y”：建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3
- 命令“conda info --envs”：再次查看一下我们的conda环境
- 命令“conda deactivate ”：退出当前环境
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