fastqc是一款用以评价测序质量的软件。
我们在去接头的步骤中，通常要知道序列的接头是什么，有些时候数据给的信息比较模糊，自己无法找到特定的序列。
此时可以用fastqc对数据进行一个评估，fastqc下载安装后解压便可以直接使用
fastqc -o 输出的目录 -t 4（四个线程） 输入文件
重点关注生成html文件，找到打红色叉的adapter content ，可以通过这几个序列进行一个统计，作为接头adapter。
fastqc是一款用以评价测序质量的软件。
我们在去接头的步骤中，通常要知道序列的接头是什么，有些时候数据给的信息比较模糊，自己无法找到特定的序列。
此时可以用fastqc对数据进行一个评估，fastqc下载安装后解压便可以直接使用
fastqc -o 输出的目录 -t 4（四个线程） 输入文件
重点关注生成html文件，找到打红色叉的adapter content ，可以通过这几个序列进行一个统计，作为接头adapter。
fastqc是一款用以评价测序质量的软件。 我们在去接头的步骤中，通常要知道序列的接头是什么，有些时候数据给的信息...
以上两张图是fastqc的结果，都表明样本序列中是含有接头序列的，adapter content的结果为fail。...
详细的教程官方已经给出。这里记录自己常用的方法： 什么是 5’接头，就是一段序列之后跟了adapter。 XX...
用FastQC或Trimmomatic去接头，低质量碱基 Fastqc 1、可直接对.fq.gz压缩文件操作2、结...
检查是否正常安装 在NCBI中寻找两条序列利用prefetch下载此序列 转为fastqc的格式 用fastqc分...
目录安装配置JDK环境序列数据质控** -序列质量评价FastQC**** -序列数据过滤Trimmomatic*...
1从EBI下载fastq格式的文件 2 fastqc质控 3 去除solid small rna adapter ...
fastqc 只作为质测，看最后一部的结果分析，如果接头没去，再用去接头的软件，得到clean. hista2 作...
拿到NGS全基因组下机序列以后肯定是Fastqc+Cutadapt+Trimmomatic去引物序列，匹配序列对原...
【生信】cutadapt①基本使用方法 cutadapt能够查找并去除接头（adapter），测序引物（prime...
本文标题：找不到序列接头adapter？试试fastqc
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/whegrctx.html
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