我国传统中医理论的最大特点是整体观念，它根植于我国传统文化，所谓整体观念包含两个方面的内容，首先宇宙是一体的，人是整个宇宙的组成部分，因此人与自然和社会环境是密切相关的，外部因素影响人的人的健康和疾病发生，因此治病不能只关注人体本身，还要将外部因素结合起来一起考虑。
比如春温夏热，阳气由弱转强，气血向外，因而皮肤松弛，腠理开泄而多汗；秋凉冬寒，阳气由盛到衰，气血收敛，皮肤收缩，腠理致密而多尿。
一天二十四小时，分十二个时辰，也如一年四季一样，晨如春、午如夏、傍晚如秋、夜晚如冬，中医还有子午流注学说。
另外地理环境和社会环境等都与人的健康相关。
其次，人体就是一个小宇宙，人体虽然由很多部分组成，但人体是一个有机整体，各个部分是相互影响的，不能头痛医头，脚痛医脚。
从天人合一的角度，中医理论包括精气神学说、阴阳学说和五行学说，有人将这三种学说分别归于哲学上的一元论、二元论和多元论，其实这是受了西方哲学思维方式的影响，静态地看待宇宙的起源问题，把宇宙的起源归于某种元素，而中国哲学更强调原动力，其实无论是精气神、还是阴阳和五行，其实都是一气，这一点黄元御讲的最清楚明白。
从人体是一个整体的角度，人体由五脏、六腑、五体、九窍、经络、气血、津液组成，其中五脏是核心，六腑为辅助，与五体、九窍内外联动，贯通内外，气血运行于经络，津液输布于全身，全体协调运行，维持生命运动。
人的这种整体性，既反映在生理机能上，也反映在病理机制上，因此人体生理和病理上的这种相互联系和影响，决定了我们在养生和治疗时，可以通过观察五官、形体、色脉等外在变化，来了解和判断脏腑经络的内在病变，而对局部病变的治疗，也必须从整体出发，制定相应的整体施治方案。
五脏包括肝、心、脾、肺、肾；六腑包括胃、小肠、大肠、胆、膀胱和三焦；皮、脉、肉、筋、骨为五体，眼、耳、鼻、口、舌、前阴和肛门为九窍，头面部的眼、耳、鼻（鼻腔）和口（嘴唇，非口腔）为五官；人体的经络系统包括十二正经、十二经别、奇经八脉、十五络脉、十二经筋、十二皮部等。
最常用的是十二正经和奇经八脉，十二正经包括手三阴经（手太阴肺经、手厥阴心包经、手少阴心经）、手三阳经（手阳明大肠经、手少阳三焦经、手太阳小肠经）、足三阳经（足阳明胃经、足少阳胆经、足太阳膀胱经）、足三阴经（足太阴脾经、足厥阴肝经、足少阴肾经）；奇经八脉包括督脉、任脉、冲脉、带脉、阳维脉、阴维脉、阴跷脉、阳跷脉的总称。
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