Linux环境下的软件安装

Linux怎么安装软件

conda ：Linux系统的应用商店
在服务器上下载conda或者conda的精简版miniconda

1. 在搜索引擎搜索miniconda
   
   2. 查看自己服务期的配置 uname -a
   
   3. 对应自己的服务器位数，在刚刚的官网下载最新版的miniconda，或者其它版本，复制相应链接
   
   4.在服务器的自己想要的安装目录下使用 wget 刚刚复制的链接 进行下载miniconda
   
   5. 安装成功后，source ~/.bashrc，成功

添加镜像

# 使用清华镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes

常用命令

• 查看软件列表：conda list
• 搜索conda软件 conda search 软件名
• 安装软件：conda install fastqc -y
• 卸载软件：conda remove fastqc -y
• 查看当前环境：conda info --envs
• 创建环境：conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
• 激活环境：conda activate XXX
• 退出环境：conda deactivate

Linux安装软件.png