沉香气味芳香，性辛，微温，无毒，具有行气镇痛、温中止呕、纳气平喘等功效，常用于治疗气逆胸满、喘急心绞痛、积痞、胃寒呕吐、霍乱、男子精冷、恶气恶疮等症。
现代研究表明沉香在治疗消化系统疾病、呼吸系统疾病、心脑血管疾病、神经系统疾病以及外科、妇科、儿科、五官科和皮肤科疾病等方面历代都有显着疗效，在抗肿瘤、抗风湿病以及美容等方面有较好的作用。
北京同仁堂大药房里所记载的一千多个中医药方子里，用到沉香的药方多达三百个！ 《中国基本中成药》中使用沉香的中成药达四十七种。如：时疫救急丹、大活络丹、回天再造丸、沉香化滞丸、理气舒心丸、小儿奇应丸、十香返生丹、清心滚痰丸、妇宁丸、妇科通经丸、洁白丸等等。
中医典籍的相关记述也甚多，如《本草备要》谓之“能下气而坠痰涎，能降亦能升，气香入脾，故能理诸气而调中，其色黑。体阳，故人右臂命门，暖精助阳，行气不伤气，温中不助火。”
《大明本草》谓之“调中补五脏，益精壮阳，暖腰膝，止转筋吐泻冷气”； 《本草纲目》谓之能“冶上热下寒，气逆喘急，大肠虚闭，小便气淋、男子精冷。”从中医的角度来说，焚香当属外治法中的“气味疗法”。
沉香在药理上的多种应用
（一）国产沉香煎剂对人型结核杆菌有完全抑制作用；
（二）对伤寒和福氏痢疾杆菌，亦有强烈抗菌作用；
（三）沉香有镇静、止喘作用；
（四）沉香对中枢神经有抑制作用；
（五）沉香有降压作用；
（六）沉香有抗心律失常和抗心肌缺血作用；
（七）最新研究发现沉香还有明显的抗癌作用。
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