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【三维基因组】浅谈三维基因组多组学联合-part5

【三维基因组】浅谈三维基因组多组学联合-part5

作者: XuningFan | 来源:发表于2020-03-23 13:49 被阅读0次

    Capture Hi-C:是一项整合了Hi-C和探针特异性富集的技术,它可以用于鉴定特定区域的染色质互作。 广泛用于构建特定区域高分辨率互作图谱和鉴定高可信的互作元件。

    例如2018年捕获Hi-C测序鉴定33个乳腺癌风险基因座潜在的110个靶基因,利用Capture Hi-C(CHi-C)技术在6种细胞系中对68个乳腺癌风险基因座进行高通量测序,捕获潜在的靶标基因,并对潜在的靶标基因进行eQTL分析,寻找到22个显著的SNP-基因组合,最后直接了候选的靶基因的表达水平与的患者预后之间的关系。

    荧光原位杂交是一种应用荧光物质依靠核酸探针杂交原理在细胞核中或染色体上显示细DNA位置与含量的方法。它在三维基因组学的主要应用在于在原位定位特定序列的位置和确定两个或多个位点在空间位置的共定位。

    在回顾了多个组学之后呢,我们再次总结一下我们为什么需要多组学验证。首先多组学之间是相互关联的,互为因果,相互补充,互为印证的。

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