2019-07-29 两文件取交集

作者: 阿乜太帅 | 来源:发表于2019-07-29 20:42 被阅读0次

gawk 'ARGIND==1{a[$1]=$1} ARGIND==2{if(a[$1]!="") print $0}' geneid.txt tpm.txt > gene.tpm.txt

awk 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}NR>FNR{if($1 in a)print a[$1]"\t"$0}' A B > C

awk 'NR==FNR{a[$1]=$0;next}{if ($1 in a){print a[$1]"\t"1} else {print $0"\t"0}}' A B  > C

 grep -w -A 1 -Ff genename gene.fasta --no-group-separator > genename.fasta

2019-07-29 两文件取交集
bedtools intersect 常用
输出两个文件的染色体位置的交集，这里输出的是 1.bed 和 2.bed 位置取交集后的坐标，跟两文件原位置坐标信...
获取两个表差集
取两表交集取两表差值
集合运算
集合运算：并集： union （只取一遍）/union all （交集取两遍）交集： intersect 差集...
Linux如何利用两个文件生成新的文件
我们在使用Linux时经常需要在两个文本文件中取重复的行或只取不重复的，也就是取交集或并集。我们可以使用sort和...
intersect取文件交集和并集
setwd("D:/Qunar/R") first <- read.table("old_cash.txt", h...
如何从多个文件中取交集？
比如我有很多个文件（100或者1000个以上），每一个文件都包含两列信息，一列是染色体的位置信息，一列是它对应的值...
ES6数组:两个数组或数组对象取并集、交集、差集记录贴
数组取并集结果取交集结果取差集结果数组对象取交集结果取差集结果:
bedtools intersect用法 (intersectB
默认用法为：或者： 1.默认默认情况下取两个文件的交集区域： -wa -wb参数-wa 输出有overlap区域...
JAVA8 Stream流的使用
一、常用API 二、取两个List的交集