题目:MERIT: Systematic analysis and characterization of Mutational
Effect on RNA Interactome Topology
文章解读:几乎没做一个实验,一年内连发3篇顶刊SCI,这位教授厉害了!
如何区分driver mutations from passenger variants in RNA signaling networks?
driver mutations:可影响癌症表型 passenger variant:通常为无功能突变
Fig1. HCC中编码RBP的基因的突变
结论:编码RBP的基因比其他基因发生更多突变;突变对RBP结构的影响:多影响RBP表面
Fig2. Global RBP-gene regulatory networks in HCC
将eCLIP-seq和shRNA-seq的数据整合在一起(关键步骤)
Fig. 3. Somatic mutation-mediated RBP-gene regulatory network rewiring in HCC
用Circos plot画出3C这个图
学会Fig2整合数据的方式以及Fig3的Circos plot
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