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TBtools | 批量计算蛋白分子量、等电点、不稳定系数、脂

TBtools | 批量计算蛋白分子量、等电点、不稳定系数、脂

作者: 生信石头 | 来源:发表于2022-05-25 10:26 被阅读0次

写在前面

最近了解了一些与蛋白质分析相关的文稿,有TBtools老铁用户提供了不少参考资料和分析建议。早晨,他突然提起了,一些蛋白质理化性质分析相关指标的计算,鼓捣起来还是麻烦。大体意思是,「是否可以有一个批量计算的功能」?并说了一个网站“ProtParam”。
我大体看了下,Emmm....尽管网站只能单个单个处理,我们完全可以简单整个小爬虫,实现批量。作为答复,我顺手写了一下,顺便打一个界面,这样大伙有需要的都能使用,前后感觉不到30min...今天的推文也有了。

Protein Paramter Calc

咱们直接看界面



从界面来看,使用就很简单:

  1. 输入蛋白序列,Fasta 格式的就可以了
  2. 设置输出文件,或者选择输出文本框
  3. 点击 Compute

等待即可,实现逻辑上,一条序列至少要 1秒,咱们不能把对方服务器跑崩溃了。
一切正常,那么就会出现上述输出结果(或者在输出文件中)。
在excel中查看的话,那么就是以下样式



逻辑上,可以满足绝大多数有相关需求的人。

写在最后

Emmm,这个需求,我总觉得在哪里见过,但是又想不起来....不过似乎也不影响,这个月确实是太忙了。没更新啥功能,感觉儿童节那天可能不好意思跟大伙收稿费了....

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