学习小组Day3笔记- Bonnie

作者: Bonnie_wm | 来源:发表于2020-03-18 22:49 被阅读0次

linux环境下的软件安装

必做部分

  1. 安装miniconda
    wget 复制的下载链接; source ~/.bashrc激活


    d31.JPG
d32.JPG
d33.JPG

2.添加镜像(不得不说linux系统的左键复制右键粘贴太方便了)


d34.JPG

3.开始使用

查看当前所有软件列表 conda list

d35.JPG

搜索与安装软件 conda search fastqc 【这里以数据质控软件fastqc为例】

d36.JPG

卸载软件 conda remove fastqc -y

d38.JPG

选做部分

conda info --envs 查看当前conda有哪些环境;conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y建立一个名叫rnaseq的conda环境

d39.JPG

conda activate rna-seq激活新的conda环境

d310.JPG

思维导图

d3思维导图.JPG

感想

1.要认真看代码,开始我就把bash看成了base
2.豆花的教程真的很详细,按步骤来就OK了
3.大胆试,这个代码有错误再重新看一遍教程,重新敲一遍,服务器用不坏让我有恃无恐

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