集相关关系图、箱线图、直方图等于一身的R绘图包-GGally

发现一个功能强大的R包GGally，可以用于多维度呈现变量的属性，以箱线图、直方图、密度图等呈现出来，而且还可以展示变量间的相关关系，分组展示组间差异等等。总之，这个包可以看成是很多基础绘图的集成。值得学习一下。

1. 以iris数据集为例演示该包的功能特点

# install.packages("GGally")
library(GGally)

iris[1:4,]
#   Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
# 1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
# 2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
# 3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa
# 4          4.6         3.1          1.5         0.2  setosa

ggpairs(iris[1:4]) 

image.png

假设只有一组：

iris$Group = "flower"
iris$Group = as.factor(iris$Group)

ggpairs(iris[,c(1:4,6)])

image.png

### 对这一个分组可视化，并添加颜色
ggpairs(iris[,c(1:4,6)],ggplot2::aes(color = Group)) # (颜色映射后，右上三角有个冗余信息，不晓得怎么去除)

image.png

美化边框

ggpairs(iris[,c(1:4,6)],ggplot2::aes(color = Group)) + 
  theme(axis.text = element_text(colour = "black", size = 11),
        strip.background = element_rect(fill = "#d63d2d"),
        strip.text = element_text(colour = "white", size = 12,
                                  face = "bold"))

image.png

分组展示

ggpairs(iris[,c(1:4,5)]) 

image.png

三个分组，加颜色

ggpairs(iris[,c(1:4,5)],ggplot2::aes(color=Species)) 

image.png

三个分组，加颜色，继续美化

ggpairs(iris[,c(1:4,5)],ggplot2::aes(color=Species)) +   # showStrips = T,  #用于显示直方图分组标签
  theme(axis.text = element_text(colour = "black", size = 11),
        strip.background = element_rect(fill = "#d63d2d"),
        strip.text = element_text(colour = "white", size = 12,
                                  face = "bold"))

image.png

参考资料：

官网: GGally: Extension to ggplot2
深度参考: 微信公众号@‘育种数据分析之放飞自我’ :性状相关可视化 | 小甜甜VS牛夫人