美文网首页
相似性分析---------不能尽信教程

相似性分析---------不能尽信教程

作者: 阿酒88 | 来源:发表于2020-11-27 14:34 被阅读0次

    相似性分析可以使用如下这个高集成函数,作图高大上

    用法仅需两行:

    library(PerformanceAnalytics)

    chart.Correlation(all[,2:10], histogram=TRUE, pch=19,method="spearman")

    数据格式:

    结果输出:

    这个软件包人气比较旺,在各大可视化教程均可以看见它的身影,但是图例左上角的* 解释就不那么一致了。

    教程一(错误的解释):

    在这里简单介绍一下这个图怎么去看:

    里面的点,代表每一个样本,*代表显著性,***代表p小于0.01,图中的数值则为相关性

    教程二(错误的解释):

    提取了实际的 pvalue,核对后改说法均不正确:

    R包源码:

    #borrowed from printCoefmat

    Signif<-symnum(test$p.value,corr=FALSE,na=FALSE,

    cutpoints=c(0,0.001,0.01,0.05,0.1,1),

    symbols=c("***","**","*",".",""))

    根据源码:

    .是pvalue 小于0.1大于0.05

    1星是pvalue 小于0.05大于0.01

    2星是pvalue 小于0.01大于0.001

    3星是pvalue 小于0.001

    相关文章

      网友评论

          本文标题:相似性分析---------不能尽信教程

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/xtexwktx.html