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用高版本的R的人注意了

用高版本的R的人注意了

作者: gtt儿_生物信息学习 | 来源:发表于2019-10-22 15:48 被阅读0次
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")

当我们安装R包的时候出现了以下错误

Error: With R version 3.5 or greater, install Bioconductor packages using BiocManager; see https://bioconductor.org/install

点开链接会告诉我们以下信息
在R3.5以及之后的版本,安装Bioconductor包都需要用BiocManager。
那如何用BiocManager安装包呢:
首先安装BiocManager,命令如下:

install.packages("BiocManager")

然后

BiocManager::install("ggplot2")

即可以把我们需要的包安装了
如果想要查看BiocManager可以安装哪些包,其中在官网上有链接:
https://bioconductor.org/packages/release/BiocViews.html#___Software
也可以用命令查看

BiocManager::available()

如果我们想要查某一个包是否在BiocManager里,可以用

BiocManager::available("ggplot2")

可以看到含有ggplot2这几个字符的包有以下几个


image.png

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