2023-06-27 | HTSlib的应用

HTSlib就是一个c语言的库来用作高通量数据的读和写，以下的这些都是在处理高通量数据常用的一些软件，他们都是用的HTSlib

• bcftools

• bgzip

• htsfile

• samtools

• tabix
  我们经常装一些软件的时候，有时候会报错缺少htslib，这可能就是依赖了htslib

• Bonfield JK, Marshall J, Danecek P, Li H, Ohan V, Whitwham A, Keane T, Davies RM, HTSlib: C library for reading/writing high-throughput sequencing data, GigaScience (2021) 10(2) giab007 [33594436]

• Danecek P, Bonfield JK, Liddle J, Marshall J, Ohan V, Pollard MO, Whitwham A, Keane T, McCarthy SA, Davies RM, Li H, Twelve years of SAMtools and BCFtools, GigaScience (2021) 10(2) giab008 [33590861]