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深入解读 MongoDB CDC 的设计与实现

深入解读 MongoDB CDC 的设计与实现

作者: Flink中文社区 | 来源:发表于2023-08-31 17:52 被阅读0次
    开发者社区.png

    作者:千浪@阿里云研发工程师

    MongoDB CDC 概述

    MongoDB 是当下流行的一个基于文档的非关系性数据库。MongoDB CDC [1] 是 Flink CDC 社区 [2] 提供的一个用于捕获变更数据(Change Data Capturing)的 Flink 连接器,可连接到 MongoDB 数据库和集合,并捕获其中的文档增加、更新、替换、删除等变更操作,生成标准的 Flink Changelog 事件流,支持通过 Flink SQL 或 DataStream API 进行数据加工, 加工之后可以方便地写入到 Flink 所支持的各种下游系统中。

    MongoDB CDC 核心功能

    全增量一体化读取

    在实际的业务场景中,常常需要同时采集 MongoDB 数据库中的存量数据以及增量数据。MongoDB CDC 能够一体化地读取全量数据和增量数据。在启动选项配置为 initial 模式时,CDC 会首先对目标集合进行扫描,并对现存的每一条数据各发送一条 Insert 记录;快照完成后,CDC 会自动转换为增量模式,开始捕获连接器启动后到来的变更数据。期间支持在任意时刻的故障恢复,且保证提供不丢不重的精确一次(Exactly-Once)语义。

    支持多种消费模式

    针对不同的场景需求,MongoDB CDC 可以设定为从以下模式中启动:

    • latest 模式

      • 在此模式下,MongoDB CDC 不会处理启动前已经存在的数据,只针对启动后到来的变更数据产生变更记录。这意味着连接器只能读取在连接器启动之后的数据更改。
    • initial 模式

      • 在此模式下,MongoDB CDC 会先对全部存量数据进行快照,待快照完成后再开始捕获变更数据。
    • timestamp 模式

      • 在此模式下,MongoDB CDC 会捕获给定的时间戳之后发生的变更数据。时间戳的取值必须在 MongoDB 的有效日志记录范围内。

    支持产生完整变更事件流

    MongoDB 6.0 之前的版本默认不会提供变更前文档及被删除文档的数据;利用这些信息只能实现 Upsert 语义(即缺失了 Update Before 数据条目)。但在 Flink 中许多有用的算子操作都依赖完整的 Insert、Update Before、Update After、Delete 变更流。如果需要补充缺失的变更前事件,一个自然的思路是在 Flink 状态中缓存所有文档的当前版本快照;在遇到被更新或删除的文档时,查表即可得知变更前的状态。然而在最坏的情况下,这种操作可能需要保存相当于 100% 原始数据量的记录。

    目前,Flink SQL Planner 会自动为 Upsert 类型的 Source 生成一个 ChangelogNormalize 节点,并按照上述操作将其转换为完整的变更流;代价则是该算子节点需要存储体积巨大的 State 数据。

    1.png

    MongoDB 6.0 的 Pre- and Post-Image 新功能 [6] 提供了一个更高效的解决方案:只要启用 changeStreamPreAndPostImages 功能,MongoDB 就会在每次变更发生时,在一个特殊的集合中记录文档变更前后的完整状态。MongoDB CDC 支持读取这些记录并产生完整事件流,从而消除了对 ChangelogNormalize 节点的依赖。

    基于心跳的标记推动机制

    目前版本的 CDC 实现需要全局唯一的回溯标记(Resume Token)来定位变更流的位置。然而 MongoDB 并不会无限地存储所有的日志,较早的变更记录可能会在保存时间超限或日志大小超限时被清除。

    对于变更频繁的集合,清除记录并不会带来什么问题,因为每次获取最新的变更条目时都会一并刷新回溯标记,始终保证回溯标记的有效性。但对于一些变更非常缓慢的集合,可能出现“上一次变更非常久远,导致其对应的回溯标记已经被清除了”的情况,这意味着无法再从流中进行恢复并读取下一次变更(由于回溯标记不存在而无法定位)。

    MongoDB 提供了解决这一问题的“心跳机制”选项,在流中没有变更数据时,也可以通过发送心跳包以刷新回溯标记。这样对于变更缓慢的集合也能保持其回溯标记更新,而不至于过期。可以通过 MongoDB CDC 的 heartbeat.interval.ms 选项来启用心跳机制。

    MongoDB CDC 的设计方案

    根据使用的技术方法不同,MongoDB CDC 的技术演进过程大致分为三个阶段:最早的 CDC(如早期的 Debezium MongoDB 等)基于查询 OpLog 日志集合实现,主要面向 MongoDB 的早期版本;第二阶段升级到了基于 MongoDB 3.6 提供的 Change Stream API 设计;在第三阶段,也就是最新的版本中,Flink CDC 社区实现了基于 FLIP-27 和增量快照算法的设计。

    第一阶段:基于 OpLog 的设计方案

    早期的 MongoDB 没有为变化监测的需求设置特别的 API。但为了支持主—副节点分布式部署情况下的数据同步和故障恢复,MongoDB 会将数据库中的所有文档操作记录写入一个特殊的系统集合 sys.oplog [3]。每条记录的格式如下:

    {
      "ts": Timestamp(1625660877, 2),
      "t": NumberLong(2),
      "h": NumberLong("5521980394145765083"),
      "v": 2,
      "op": "i",
      "ns": "test.users",
      "ui": UUID("edabbd93-76eb-42be-b54a-cdc29eb1f267"),
      "wall": ISODate("2021-07-07T12:27:57.689Z"),
      "o": {
          "_id": ObjectId("60e59dcd46db1fb4605f8b18"),
          "name": "1"
      }
    }
    

    其中 ts 段用于记录操作发生的唯一时间戳(第一位为 Unix epoch 时间戳,第二位为这一秒内的版本号) ;ns 记录了操作的数据库和集合、op 是进行的操作(例如 i代表插入)、o 是被插入的文档。连接器只需持续查询 OpLog 集合,即可获取时间顺序的最新数据,并产生对应的日志流。

    需要留意的是,MongoDB 出于日志记录开销的考量,只会记录更新操作发生变化的字段;删除操作中只包含被删除文档的 _id 字段。因此这类基于 OpLog 的 CDC 实现需要额外的操作(例如,在 Update 后查询完整文档信息)才能产生 Flink Upsert(包括 Insert、Update After、Delete)事件流。由于 OpLog 并不记录更新前及删除前的文档数据,这类 CDC 通常不能产生 Update Before 事件。

    除此之外,MongoDB 数据库的每个分片都有自己的 OpLog 集合,因此连接器需要同时和每个分片建立连接并处理同步问题,实现较为繁琐。

    第二阶段:基于 Change Stream API 设计方案

    MongoDB 3.6 引入了新的 Change Stream (变更流)API [4],支持数据库、集合层面的变更信息订阅,并提供了基于 Resume Token 的断点续传机制。例如,使用 db.<collection_name>.watch(),就可以订阅对应集合的操作变更,返回的每条变更记录数据的格式如下:

    {
      // Resume Token
      _id: { _data: '...' },
    
      // 操作类型
      operationType: 'insert',
    
      // oplogs 中记录的时间戳
      clusterTime: Timestamp({ t: 1686638232, i: 1 }),
    
      // 精度更高的时间戳,MongoDB 6.0 后可用
      wallTime: ISODate("2023-06-13T06:37:12.290Z"),
    
      // 插入的完整文档信息
      fullDocument: {
        _id: ObjectId("64880e8a9f46de45aa2630a4"), 
        fieldKey: 'fieldValue'
      },
    
      // 更新的 database 和 collection
      ns: { db: 'testdb', coll: 'testtable' },
    
      // 插入文档的唯一 ID
      // 分片集合中还包括分片键
      documentKey: { _id: ObjectId("64880e8a9f46de45aa2630a4") }
    }
    

    相比于读取 Oplog 的方式,基于变更流 API 的 CDC 具有这些优势:

    • 对分片集群支持更好。要订阅分片集合的全部变更操作,也只需要建立一个变更流游标;
    • 方便进行恢复。只需要记录每条记录的 Resume Token,即可在有效期限内任意回溯;
    • 支持自动获取变更后完整文档。可以通过参数配置获取包含更新后完整文档的变更记录。

    早期版本的 MongoDB CDC 就通过变更流 API 实现了流式更新的订阅。

    第三阶段:基于增量快照算法的设计方案

    CDC 的变更监测操作通常分为两步:第一步是在启动时对当前数据库中的状态进行完整快照(Snapshot),第二步是监控实时的流式数据变更。早期版本的快照阶段为单并发读取,且不支持 Checkpoint 与故障恢复。这意味着在数据量很大时,快照阶段执行将花费相当长的时间,且一旦失败必须从头开始。FLIP-27 提案 [5] 给出了下一代 Flink Source 架构,将从源读取数据的职责抽象为两个模块,如下图所示:

    2.png
    1. SplitEnumerator,负责管理并将数据源拆分为多个抽象分片;

    2. Reader,负责从抽象分片中读取实际的数据。

    运行时,读取数据的过程也分为两个步骤:

    1. 一开始,执行 SplitEnumerator,将全部数据拆分成抽象分片;

    2. 将每个抽象分片分配给 Reader,并执行实际的读取逻辑。

    Enumerator 和每个 Reader 各有自己的 Checkpoints,均支持故障恢复。各 Source 也无需自己维护分片、并发模型问题。

    MongoDB CDC 在 Flink CDC 2.3 版本开始迁移到这一新的 Source 架构。在进行快照时,MongoDB CDC 需要将待快照的集合按 Key 进行拆分,策略如下:

    • 如果目标集合为分片集合,则按照实际的物理分片进行拆分;
    • 否则,使用 MongoDB 提供的 splitVector 函数均匀分片;
    • 如果无法调用 splitVector 则使用启发式算法,抽样估计文档的平均大小,并按数据行数进行拆分。

    得到的每个分片都对应一个 MinKey 和 MaxKey 指定的文档范围,称作快照分片(SnapshotSplit)。

    而在流式读取阶段,我们只需要指定数据流的起止时间点,确定要监控的流数据记录范围即可。这样的分片称为流式分片(StreamSplit)。如果将停止时间点设定为 MAX_TIMESTAMP(可表示的最大时间戳),则代表这是一个不限定停止时间点的无界流分片。

    目前,启用了增量快照功能的 MongoDB CDC 使用 FLIP-27 推荐的 Source 接口定义方式 SplitEnumerator 会首先拆分存量数据,产生快照分片;在监测到全部的快照分片均完成之后,才会继续产生流式分片,转为流式读取。

    TaskFetcher 在收到待处理的分片后,就会按照其类型(快照或流式)将其传递给对应的 SplitFetchTask 进行实际的读取工作。ScanSplitFetchTask 会根据传入的快照分片界定的 Key 范围从 MongoDB 数据库中读取存量数据;StreamSplitFetchTask 则会订阅 Change Stream API 来获取变更数据。

    3.png

    所有 SplitFetchTask 产生的记录都会被放入事件队列中,并由 RecordEmitter 转发给指定的反序列化器;反序列化器将其转化为最终的 RowData,交给下游消费。

    出于兼容性考虑,使用传统 SourceFunction 定义的 MongoDB Source 仍然存在于目前版本的 MongoDB CDC 中,用于非增量快照模式。但这种定义方式已被 Flink 标记为不推荐的(Deprecated)用法,且将来可能会被删除。

    MongoDB CDC 的底层实现

    目前版本的 Mongo CDC 实现大量依赖 MongoDB 底层为变化数据的捕获提供的支持,如变更流 API、分片集合支持、变更前后快照等功能。下面详细介绍这些功能的底层机制,对底层原理不感兴趣的读者可以快速跳过本章节。

    基于 Change Stream API 的 CDC 技术

    上文提到,基于变更流 API 捕获变更数据相比于读取 OpLog 的实现更简单有效。然而实际上 MongoDB 的变更流 API 底层也是基于 OpLog 实现的,是在 OpLog 上提供的一层封装。它们存在以下的对应关系:

    • 变更流中的每条记录都有着唯一的 _id(即 Resume Token),对应 OpLog 集合中的一次操作日志;
    • 变更流中的 namespace、updateDescription、operationType 等字段和 OpLog 中记录的内容一一对应。

    在此基础上,变更流 API 提供了以下便利:

    • 支持通过任意有效的 Resume Token 回溯变更流

    由于通过 Resume Token(即 OpLog 记录的_id 字段)可以查找出 OpLog 中对应的操作记录,从而自对应位点开始消费接下来的变更数据。

    • 支持从特定的 Timestamp 开始回溯变更流

    MongoDB 提供了 startAtOperationTime 选项开启变更流,支持从给定的时间戳处开始读取变化。由于 OpLog 集合中包含了所有变更的时间戳,且按照时间有序排列,所以只需进行二分查找即可定位到给定时间戳对应变更流中的位置。

    目前的 MongoDB 实现有个特殊的限制:如果指定的 Timestamp 发生在过去(即需要在 OpLog 中查找变更的起始点),则需要保证这一 Timestamp 在 OpLog 记录的日志范围内。这一限定很好理解:如果给定的时间戳在未来,则无需进行二分查找,只需等待该时间戳之后的变更数据到来再开始捕获即可;但如果给定的时间戳在过去,则只能在 OpLog 记录的范围内才能进行可靠的二分查找;如果该时间戳比当前 OpLog 最早的数据还要早,则 MongoDB 无法确定在它们之间是否有其他变更;即使有,也无法从该处恢复了,因为这些变更对应的 OpLog 日志已经被清除了。MongoDB 在遇到这种情况时会拒绝回溯。

    4.png
    • 支持 Full Document Lookup 功能

    OpLog 为了节约存储开销,只会存储最少必要的变更数据。例如,对于一次更新操作,MongoDB 并不会将变更后完整的文档记录下来,而是只存储那些发生了变化的字段;即 OpLog 里面的更新操作日志中记录的不是完整的文档,不是很实用。如果需要完整的文档信息,还需要对 OpLog 中每条更新记录手动查找一次。

    变更流 API 则将这一查询需求进行了包装:只需使用 fullDocument: updateLookup参数,MongoDB 就会在读取到 Update 事件时,在返回的记录中补充完整的文档,并记录在 fullDocument 字段中。注意这仅适用于 Update 类型的操作,因为 Insert 操作总是包含完整文档信息(因为插入操作前该文档还不存在);Delete 操作总是只包含 _id 信息(因为已被删除的文档无法再查找)。

    需要注意的是,MongoDB 不保证 updateLookup 给出的文档一定与该更新操作的结果对应。也就是说,连续对同一文档进行 Update 操作产生的变更流记录,较早变更查出的 FullDocument 可能被较晚变更的内容覆盖。

    5.png

    这和手工读取 OpLog、再手动读取 Full Document 的问题是一样的。不过由于 MongoDB 的每个文档都具有唯一的 _id字段,因此在 Upsert 模式的数据流中这一问题不会对结果产生太大影响。

    MongoDB 分片集合的支持

    MongoDB 的每个分片节点都具有自己的 OpLog 集合,分别记录属于自己分片的变更数据;这意味着如果需要基于 OpLog 监控分片集合的变更,则需要并行地监控每个分片的 OpLog 集合,并手动处理同步问题、按照时间戳对来自不同分片的变更日志进行排序并输出,难度和风险都比较高。

    而变更流 API 对分片集合的变更捕获进行了封装,使其更加易用。即使通过变更流 API 订阅的是分片存储的集合,也只会产生唯一一个变更流游标,其中包含了来自所有分片的变更数据;且提供了很强的有序性保证,即产生的变更数据总是时间有序的。

    MongoDB 的实现方式是给分片集合设计一个中心化的管理节点,负责从各个节点获取记录并排序,从而产生有序的输出。每个节点内部的 OpLog 记录总是有序的。那么在所有节点都给出一条该节点内最早的记录之后,其中最早的那一个就可以认为是全局最早值,可以发送给订阅 Change Stream 的客户端了。

    但是这样其实会有问题:如果其中有个节点的数据始终没有被更新,那么它就不会给出变更记录;这样,中心节点就无法确认这个节点到底是很久以前有更新,只是一直没发出来记录,还是确实没有数据;这样就无法推进全局时间戳了。

    MongoDB 对这一问题的解决方案和 Flink 的 Watermark 机制很类似:MongoDB 要求每个节点即使没有变更数据,也需要定期向中心节点发送一条空白指令。这样中心节点就可以确认每个节点的同步状态,从而推进全局时间戳。

    高效地支持变更前后快照

    Change Stream 底层是基于 OpLog 实现的,而 OpLog 不记录更新和删除前的文档信息。为了支持“获取变更/删除前文档”这一需求,MongoDB 不得不额外在某个位置保存这一信息。出于兼容性的考量以及储存开销原因,MongoDB 没有选择修改 OpLog 格式来储存额外字段,而是在特殊的集合中存储变更前后的文档信息(称为 Pre- and Post-Images),并提供了集合粒度的开关控制。

    由于针对每次变更和删除操作都记录下前后快照的开销并不小,所以 MongoDB 提供了许多开关防止状态膨胀,例如:

    • 支持在系统层面配置变更前后快照的过期时间:
    db.runCommand({
      setClusterParameter: {
        changeStreamOptions: {
          preAndPostImages: {
            expireAfterSeconds: '600' // 设定过期时间为 600 秒
          }
        }
      }
    })
    
    • 支持对每个集合单独配置变更前后快照开启与否:
    db.runCommand({
      collMod: "testtable", 
      changeStreamPreAndPostImages: {
        enabled: true // 配置对 testtable 集合中的变更记录快照
      } 
    })
    
    • 支持对每个变更流游标选择是否读取变更前后快照:
    db.testtable.watch({
      // 配置是否读取变更后快照
      fullDocument: 'required',
    
      // 配置是否读取变更前快照
      fullDocumentBeforeChange: 'required'
    })
    

    为什么要同时存储变更后的文档呢?之前提到的将 FullDocument 设定为 updateLookup 的方法,虽然可以得到变更后的完整文档信息,但却不能保证得到的一定是这一次更新之后的文档信息。例如,在连续进行两次更新操作时,可能会出现前一次更新操作的 FullDocument 被后一次覆盖的情况。究其原因,是因为这一信息是事后独立查询(Lookup)的,而非和变更事件本身相关联。

    而变更后文档记录是在每次变更触发器中存储的,和特定的 OpLog 变更条目相关联,因此可以保证记录的文档反映了该变更的结果;将 fullDocument 选项设定为 required 或 whenAvailable 时,即可要求从变更后快照中读取记录,而非进行“事后查询”。

    在启用 scan.full-changelog 选项时,MongoDB CDC 会要求从变更后文档记录中产生 Update After 事件,从而确保每条 Update After 事件与实际变更操作一一对应。这是通过 ChangelogNormalize 算子将 Upsert 流正规化的实现方式无法保证的。

    Announce: Flink CDC 社区新增 Maintainer 成员

    Flink CDC 社区的快速发展离不开贡献者们的无私奉献,截止目前社区的贡献者已经超过 100 人,贡献者群体持续扩大。经过 Flink CDC 社区 Maintainer 成员提议, Flink CDC 社区已经正式邀请 whhe (川粉) 加入 Flink CDC 社区的 Maintainer 列表。

    6.png

    川粉老师是 OceanBase 开源团队的研发工程师,主要负责 OceanBase 的开源生态对接和社区治理相关工作,他长期活跃在 Flink CDC 社区,参与了多个版本的开发工作,作为核心贡献者在社区贡献了包括 OceanBase CDC Connector 在内的多个 PR,同时在用户群和 issue 列表中帮助积极帮助用户解决问题,为社区发展做出了持续的贡献。期待川粉老师作为 Flink CDC 的 Maintainer,为社区的发展带来更多数据库侧的视角,帮助更多的社区贡献者和用户,也希望未来能有更多的贡献者可以加入 Maintainer 列表,不断推动社区的发展。

    阿里云实时计算 Flink 基于 Flink 1.17 的企业版 Flink 已正式发布 [7],在该版本中 MongoDB CDC 连接器已开始公测,支持任意时间戳消费、完整事件流等功能 [8]。欢迎使用!

    参考

    [1] MongoDB CDC 社区文档:

    https://ververica.github.io/flink-cdc-connectors/release-2.4/content/connectors/mongodb-cdc%28ZH%29.html

    [2] Flink CDC 社区官网:

    https://ververica.github.io/flink-cdc-connectors/

    [3] MongoDB Oplog 文档:

    https://www.mongodb.com/docs/manual/core/replica-set-oplog/

    [4] MongoDB 变更流文档:

    https://www.mongodb.com/docs/manual/changeStreams/

    [5] Apache Flink FLIP-27 提案:

    https://cwiki.apache.org/confluence/display/FLINK/FLIP-27%3A+Refactor+Source+Interface

    [6] MongoDB PreImages 文档:

    https://www.mongodb.com/docs/atlas/app-services/mongodb/preimages/

    [7] 阿里云 MongoDB CDC 文档:

    https://help.aliyun.com/zh/flink/developer-reference/mongodb-cdc-connector

    [8] 阿里云 Flink 实时计算 Release Notes:

    https://help.aliyun.com/zh/flink/product-overview/august-21-2023

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