日常 | 2022-04-02 | 软件的版本问题不容忽视

在平时的分析中，往往会忽视软件版本的问题，认为就算有差距，也不会太大。但最近的转录组比对过程中，不同版本hisat2的比对率结果天差地别。

因为公司的结果，所有样本比对率都非常高，但我的结果中部分样品差的离谱。对比不同样本的质控报告，差的样本明显不太行，我还一直以为可以调整fastp参数得到改善，一顿操作之后比对率不升反降。因为还有部分样本的结果还是很好的，根本没想到是软件版本的问题，我甚至以为公司的结果有一些操作在里面。

跟技术人员沟通后，发现虽然只差一个小版本，但这就是问题所在。

差这么多，感觉挺离谱的。我也得到了教训，不要想当然的“......不可能，绝对......”，以后分析过程中也要时刻注意软件的版本问题。