想必大家都有过手动安装软件的各种痛苦吧，这里给大家推荐一款自动安装软件和管理软件的宝藏工具——miniconda3

下载安装包

wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
sh Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

安装的时候会问你是否加载到环境变量，当然你也可以自己加载到环境变量

echo 'export PATH=your path:$PATH' >> ~/.bashrc

#设置conda安装软件的镜像
vi ~/.condarc #设置conda安装软件的镜像
#这里推荐使用北外或者中科大的镜像，如果遇到安装不上的问题就换一下镜像多试几次。
channels:
 - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
 - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/msys2
 - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
 - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/menpo
 - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch
 - https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/simpleitk
 - defaults
show_channel_urls: true

创建一个新的软件存放环境

为什么要新建一个环境呢？conda就像一个大房子，我们建的环境就像一个一个的存储柜，当其中的一个柜子坏掉之后，我们直接扔掉就好，并不会影响我们整个的大房子。

conda create -n rna # -n后面接你要创建的环境的名字
conda activate rna #激活环境
conda install bwa #然后就可以装软件啦

image.png

conda deactivate #退出当前的环境 
conda info --envs #查看环境
conda env remove --name rna #删除环境
conda remove bwa #删除bwa

是不是很方便呢