asreml介绍
ASReml是拟合线性混合模型的优秀数据分析软件,由NSW Department of Primary Industries的Arthur Gilmour博士开发,可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据,实现大数据高效、快速的分析。ASReml可对数量性状、阈值性状、分类性状、SNP标记等多个性状进行分析,并可实现固定效应、随机效应值的预测以及显著性检验、遗传参数的估计、全基因组选择等。目前,ASReml软件已在世界范围内广泛地应用于林业、渔业、畜牧、农作物以及医学等多个领域的研究。
培训时间和地点
培训时间:2017年4月22日-23日(星期六、日)
上午9:00-12:00 至 下午1:30-5:30
培训地点:北京海淀区善缘街1号(中关村) 立方庭大厦二层
培训内容
2017年4月22日 上午(9:00-12:00)
R语言介绍
- R语言软件安装、读取数据
- R语言数据清洗及汇总统计
- R语言常用作图介绍
ASReml简介及应用
- ASReml在作物科学中的应用(MET、BLUP、空间分析)
- ASReml在林木科学中的应用(多性状遗传相关、空间分析)
- ASReml在水产科学中的应用(阈值性状、育种值、遗传力)
- ASReml在动物科学中的应用(动物模型、GBLUP和GS)
2017年4月22日 下午(1:30-5:30)
ASReml遗传模型
- 如何分析半同胞家系模型(计算遗传力以及配合力)
- 如何分析完全双列杂交(是否考虑系谱信息)
- 如何分析无性系数据(计算遗传力、重复力)
- 如何分析个体动物模型(包括公畜模型、公畜-母畜模型、动物模型)
- 如何计算近交系数和亲缘关系系数
- 如何计算遗传力以及标准误
- 如何计算母体效应以及永久环境效应
- 如何评价固定效应和随机效应的显著性(Wald和LRT检验)
- 如何评价和比较模型的优劣(AIC、BIC、LRT),如何调整和优化模型
2017年4月23日 上午(9:00-12:00)
多性状分析
- 连续性状相关分析(表型相关、遗传相关、环境相关)
- 阈值性状与生长性状的相关(遗传相关和表型相关)分析
- 性状相关的显著性检验
阈值性状的遗传参数评估(遗传力、育种值)
多地点试验(MET)数据分析(G by E)
空间分析及模型的比较和优化(LRT、AIC、BIC)
2017年4月23日 下午(1:30-5:30)
高通量SNP信息在数据分析中的应用
- SNP与表型性状的关联分析(SNP效应、替换效应、加性和显性效应)
- GBLUP育种值估计
- 一步法GBLUP(one-step GBLUP)
- 如何利用SNP信息进行GS分析(Genomic Selection)
ASReml国际资格认证考试
费用
- 3200元/人(优惠报名截止日期前报名并付费);
- 3500元/人(优惠报名截止日期后报名并付费---如有剩余参会名额)。
注:报名费包含培训费、讲义费、午餐费、学习资料费等,并赠送ASReml统计分析软件一年免费使用权(包含技术服务支持)。
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