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单细胞实验过程-PCR偏倚

单细胞实验过程-PCR偏倚

作者: 徒唤奈何_c5f0 | 来源:发表于2021-07-13 15:26 被阅读0次

在传统的大体系(通常指1μL以上,可以直接用移液枪进行操作的体系)单细胞扩增中,单细胞中每个核酸分子或片段在全基因组扩增等同于单分子的扩增,单分子扩增反应的是否启动与何时启动是一个随机过程。一旦一个分子的扩增被随机“启动”了,该分子在短时间内就能够获得高于其他未启动分子数倍的拷贝,而这个数目上的优势则进一步增加了其继续被“启动”的概率,并造成本该属于其他分子的扩增原料被拷贝数较大分子的扩增反应所占用,使得最终产物中某些分子的拷贝数远远大于其他分子,产物中核酸分子拷贝数的比例不能真实反应原料中相同分子的拷贝数比例,这就造成了扩增偏倚。可使用MID等碱基序列短条码区分。

单细胞和空间组的PCR过程中存在如上问题,在此记录

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