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STRING||蛋白互作数据库在线分析基因互作网络(PPI)

STRING||蛋白互作数据库在线分析基因互作网络(PPI)

作者: 斗战胜佛oh | 来源:发表于2022-04-08 09:21 被阅读0次

    String数据库(https://string-db.org/)是一个搜寻蛋白质之间相互作用的数据库。该数据库可应用于2031个物种,包含960万种蛋白和1380万中蛋白质之间的相互作用。它除了包含有实验数据、从PubMed摘要中挖掘的结果和综合其他数据库数据外,还有利用生物信息学的方法预测的结果。研究蛋白之间的相互作用网络,有助于挖掘核心的调控基因。String数据库目前更新到Version 11

    1.多个基因间的互作:

    输入一个要查看的基因list

    image

    提交后得到蛋白互作的图:

    image

    下面可以按需要的通路进行提取和最后的图片导出:

    image

    2.单个基因的互作网络

    输入单个基因名字提交即可。

    image image

    参考:https://www.omicsclass.com/article/1126

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